21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1903 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1903  hypothetical protein  100 
 
 
684 aa  1283    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3187  hypothetical protein  45.19 
 
 
669 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3511  hypothetical protein  46.08 
 
 
668 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.789255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3382  hypothetical protein  47.56 
 
 
670 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1480  OmpA/MotB domain protein  47.55 
 
 
612 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172439  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0701  hypothetical protein  48.48 
 
 
630 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127075  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  30.66 
 
 
729 aa  135  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  28.31 
 
 
707 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  30.13 
 
 
464 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  30.59 
 
 
464 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  28.8 
 
 
464 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  31.13 
 
 
463 aa  102  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  26.54 
 
 
464 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  28.94 
 
 
464 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  32.92 
 
 
463 aa  93.2  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  24.52 
 
 
459 aa  92.8  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2644  hypothetical protein  30.32 
 
 
211 aa  70.1  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0640  hypothetical protein  31.19 
 
 
213 aa  53.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0635  hypothetical protein  31.19 
 
 
213 aa  52.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  26.47 
 
 
320 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  25.58 
 
 
642 aa  45.8  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>