More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0480 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  98.82 
 
 
316 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  98.82 
 
 
316 aa  173  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  98.82 
 
 
247 aa  173  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2625  OmpA/MotB  100 
 
 
85 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0109617  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  97.65 
 
 
316 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0480  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
85 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  98.82 
 
 
320 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  96.47 
 
 
316 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  95.29 
 
 
316 aa  168  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  88.24 
 
 
310 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  88.24 
 
 
310 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  87.06 
 
 
310 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  87.06 
 
 
310 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  87.06 
 
 
310 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  87.06 
 
 
310 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  87.06 
 
 
310 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  84.71 
 
 
311 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  83.33 
 
 
320 aa  148  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  60 
 
 
277 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  51.81 
 
 
261 aa  98.2  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  54.22 
 
 
268 aa  95.9  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  52.78 
 
 
459 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  45.78 
 
 
237 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  45.78 
 
 
237 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  46.84 
 
 
445 aa  84  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  42.5 
 
 
222 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  50.63 
 
 
440 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  53.52 
 
 
464 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  45.88 
 
 
729 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  42.35 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  48.72 
 
 
543 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  48.72 
 
 
544 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 
449 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  42.17 
 
 
229 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  45.68 
 
 
220 aa  77.8  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  40.96 
 
 
240 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  43.9 
 
 
525 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  42.5 
 
 
247 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  40.96 
 
 
240 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  40.96 
 
 
236 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  50 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  39.76 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  48.19 
 
 
458 aa  76.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  45.57 
 
 
533 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  42.17 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  50 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  45.57 
 
 
463 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  47.22 
 
 
537 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.15 
 
 
542 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  44.58 
 
 
451 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  43.21 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  38.55 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  43.37 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  45.57 
 
 
533 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  43.9 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  45.12 
 
 
219 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  44.3 
 
 
205 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  42.17 
 
 
230 aa  73.9  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  49.35 
 
 
707 aa  74.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  44.58 
 
 
221 aa  74.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  39.76 
 
 
218 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  44.58 
 
 
441 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  43.37 
 
 
217 aa  73.9  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  45.07 
 
 
237 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  44.58 
 
 
219 aa  73.6  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  43.37 
 
 
206 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  41.98 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  41.98 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  41.98 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  43.02 
 
 
607 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  39.76 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.68 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  43.37 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  44.93 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  41.98 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  41.98 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  45.07 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  43.21 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  43.21 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2790  OmpA/MotB domain-containing protein  48.65 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  50.72 
 
 
537 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  43.21 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  40.96 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  43.21 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  43.21 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  43.37 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  43.21 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  39.76 
 
 
1026 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  43.21 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  43.21 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  43.37 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  43.75 
 
 
355 aa  72  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  43.21 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  45.68 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  42.17 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  45.95 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  43.21 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  43.21 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>