More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1687 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1687  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 314 aa  638    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  44.33 
 
 		 670 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  42 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  36.08 
 
 		 704 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0605  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.583916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  39.6 
 
 		 1313 aa  76.6  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  35.05 
 
 		 673 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  39.18 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  36.63 
 
 		 641 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  30.28 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  33.33 
 
 		 466 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  34.31 
 
 		 352 aa  72.4  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  34.65 
 
 		 620 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  37.11 
 
 		 510 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  24.42 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  34.65 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  29.79 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  35.64 
 
 		 630 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  28.38 
 
 		 656 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  35.92 
 
 		 658 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  35.11 
 
 		 638 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  33.85 
 
 		 710 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  32.08 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  32.67 
 
 		 525 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 1026 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  40.21 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  33.33 
 
 		 694 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  31.09 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  32.67 
 
 		 631 aa  66.2  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 449 aa  66.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 458 aa  66.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  30.08 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  36.08 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 443 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  26.24 
 
 		 388 aa  65.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  31.31 
 
 		 456 aa  65.9  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 586 aa  65.9  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  33.02 
 
 		 498 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3029  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 555 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  31.13 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  32.35 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  31.86 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0603  OmpA family protein  31.07 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  30.93 
 
 		 537 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  30.48 
 
 		 729 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  29.82 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  30.65 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  30.65 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  32.04 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  27.54 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  29.84 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  30.63 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  30.97 
 
 		 486 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  32.99 
 
 		 517 aa  63.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  31.73 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  28.81 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  28.81 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3582  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.645571  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  28.81 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  28.81 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  29.91 
 
 		 478 aa  62.8  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  30.83 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  28.81 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  30.83 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  31.37 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.65 
 
 		 707 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  33.72 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  29.23 
 
 		 509 aa  62.4  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3372  OmpA/MotB domain protein  31.58 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  hitchhiker  0.00000000701335 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  32.08 
 
 		 429 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  31.68 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  30.39 
 
 		 417 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 464 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  35.29 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  35.29 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  31.68 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  33.98 
 
 		 575 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  27.88 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  34.29 
 
 		 572 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  29.84 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  32.62 
 
 		 175 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  29.37 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  29.84 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  27.42 
 
 		 1264 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  31.37 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  29.84 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  29.52 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  31.37 
 
 		 712 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  32 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  31.68 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  29.84 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  33.96 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  31.78 
 
 		 679 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  34 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>