More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09021 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09021  putative outer membrane protein  100 
 
 		 332 aa  691    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111928  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1730  OmpA/MotB domain protein  23.23 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.262216  normal  0.802647 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  44.71 
 
 		 620 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2790  OmpA/MotB domain-containing protein  28.64 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  40.48 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  42.17 
 
 		 630 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 729 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  35.07 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  40.48 
 
 		 638 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0024  OmpA domain-containing protein  46.84 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000404844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  43.21 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  47.37 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.75 
 
 		 187 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  48 
 
 		 459 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3582  OmpA/MotB domain protein  30.22 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.645571  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 		 239 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.24 
 
 		 240 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.71 
 
 		 199 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  31.45 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  41.46 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  36.19 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  40.26 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  42.47 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  41.38 
 
 		 575 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1428  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.29 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  42.47 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1528  OmpA domain-containing protein  49.33 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000113524  normal  0.565826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  40.96 
 
 		 658 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  41.25 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  43.06 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  40.26 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  35.24 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  40.74 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  37.86 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  38.96 
 
 		 209 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  39.58 
 
 		 533 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  30.65 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  37.3 
 
 		 188 aa  68.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  35.92 
 
 		 231 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  36.59 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  42.47 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.65 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  36.59 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  36.08 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  31.15 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  34.91 
 
 		 177 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  39.76 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  36.59 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  29.84 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  29.84 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  30.86 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  37.8 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  36.94 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  39.58 
 
 		 533 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  36.94 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  36.94 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  38.14 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  35.37 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  37.8 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  40.82 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  37.8 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  37.8 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  37.8 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  36.94 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  36.94 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  37.8 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  40.51 
 
 		 641 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  36.36 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  41.77 
 
 		 670 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  38.82 
 
 		 277 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  34.45 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2563  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.67 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  36.9 
 
 		 268 aa  67  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  37.62 
 
 		 228 aa  67  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  29.84 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  42.31 
 
 		 707 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2747  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.05 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  43.21 
 
 		 727 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  41.74 
 
 		 376 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  43.04 
 
 		 214 aa  67  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  29.84 
 
 		 247 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1395  OmpA/MotB domain-containing protein  40.24 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.616253  normal  0.476019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  39.56 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2367  OmpA/MotB domain-containing protein  46.05 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000270429  normal  0.157295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2439  OmpA/MotB domain-containing protein  46.05 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  normal  0.228998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2530  OmpA/MotB domain-containing protein  46.05 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000768197  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  35.29 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  27.42 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  27.42 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  40.21 
 
 		 631 aa  66.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  41.25 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  39.51 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2218  OmpA/MotB domain-containing protein  31.15 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.906577  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  41.3 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  35.65 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1608  OmpA domain-containing protein  44.74 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000267608  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  35.65 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  39.24 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>