More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08086 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08086  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  751    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  40.76 
 
 		 613 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  47.27 
 
 		 653 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  46.02 
 
 		 677 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  47.62 
 
 		 813 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 666 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  43.64 
 
 		 585 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  43.86 
 
 		 757 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  32.84 
 
 		 643 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  43.75 
 
 		 645 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  43.24 
 
 		 660 aa  96.7  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 650 aa  95.5  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 		 798 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  38.39 
 
 		 665 aa  93.6  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  30.46 
 
 		 340 aa  92.8  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  41.96 
 
 		 630 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 		 642 aa  87.4  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 712 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 668 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  34.78 
 
 		 656 aa  77  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  34.82 
 
 		 734 aa  76.6  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  37.17 
 
 		 694 aa  76.3  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  36.94 
 
 		 626 aa  75.5  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 		 679 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0471  hypothetical protein  26.92 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0266882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 648 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  38.39 
 
 		 710 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.5 
 
 		 673 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  39.64 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  35.14 
 
 		 630 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.27 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 		 671 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  30.1 
 
 		 505 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  33.91 
 
 		 641 aa  70.1  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  34.82 
 
 		 509 aa  69.7  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  40.78 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  34.21 
 
 		 640 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  44.3 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 543 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  40.26 
 
 		 637 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  37.72 
 
 		 658 aa  67  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.04 
 
 		 542 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  39.85 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  39.85 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  44.16 
 
 		 241 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  37.62 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  33.03 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  39.29 
 
 		 239 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  39.85 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  30.88 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  35.88 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  39.85 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 		 544 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  39.85 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  43.04 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  39.85 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  39.85 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.56 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  37.5 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  40 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  31.4 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  36.52 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  35.14 
 
 		 638 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  32.09 
 
 		 672 aa  63.9  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 586 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.54 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  33.08 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  39.1 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  34.43 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  41.46 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2529  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  30.09 
 
 		 594 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  41.67 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 		 525 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 		 218 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  41.46 
 
 		 239 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  36.04 
 
 		 218 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  33.04 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 1026 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  43.37 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  41.46 
 
 		 223 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  37.17 
 
 		 669 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  45.68 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  40.48 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  40.48 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  40.48 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  42.68 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5086  OmpA/MotB domain protein  33.93 
 
 		 533 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  40.48 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  40.48 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  40.48 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  40.48 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 244 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  46.38 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  40.54 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  40.48 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 459 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  44.3 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.54 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>