23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1685 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1685  OmpA/MotB-like porin  100 
 
 		 438 aa  827    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  68.37 
 
 		 441 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  61.62 
 
 		 434 aa  246  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  59.49 
 
 		 451 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  31.45 
 
 		 707 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  36.28 
 
 		 652 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  36.28 
 
 		 652 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 459 aa  57  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  33.02 
 
 		 658 aa  57  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  32.63 
 
 		 617 aa  55.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  32.14 
 
 		 464 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  33.91 
 
 		 642 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  35.05 
 
 		 464 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  31.86 
 
 		 463 aa  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  35.63 
 
 		 109 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  34.48 
 
 		 109 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  28.85 
 
 		 768 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  32.08 
 
 		 463 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  39.78 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  32.29 
 
 		 464 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  32.65 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  30.49 
 
 		 653 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>