More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05392 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05392  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001456  protein F-related protein  77.88 
 
 		 224 aa  341  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0603  OmpA family protein  37.68 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0587  outer membrane protein, OmpA family  34.48 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  38.05 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  39.82 
 
 		 223 aa  89  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  36.13 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 217 aa  88.2  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  41.82 
 
 		 543 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.82 
 
 		 542 aa  84.7  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  36.44 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 544 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  35.59 
 
 		 510 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  42.7 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  42.7 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  35.29 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  39.62 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  38.46 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  33.59 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  37.74 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  36.84 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  31.88 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  35.59 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  31.16 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  33.59 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  33.59 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  38.68 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0765  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  34.51 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  35.34 
 
 		 296 aa  75.1  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 481 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  35.51 
 
 		 648 aa  75.1  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  26.96 
 
 		 440 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  37.4 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.43 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0845  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 		 514 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  40.59 
 
 		 321 aa  74.7  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  42.37 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 497 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  35.96 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  35.92 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 498 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  29.71 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 485 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  35.51 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  29.14 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  39.53 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  34.78 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 485 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 485 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  33.03 
 
 		 623 aa  72.8  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  35.9 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  45.35 
 
 		 229 aa  72  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  33.91 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  33.93 
 
 		 223 aa  72  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4667  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.153114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  31.58 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  32.17 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  36.28 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  27.83 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  27.83 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3084  putative outer membrane lipoprotein  36.11 
 
 		 161 aa  70.9  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  27.83 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  32.03 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  27.83 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 485 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  38.18 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  35.14 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  33.96 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  31.3 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  32.81 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  32.46 
 
 		 525 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  34.19 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  33.96 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  34.21 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  39.42 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  33.02 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  33.94 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  35.66 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  32.03 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  34.21 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  34.21 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  32.03 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  32.73 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  33.62 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  33.65 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  31.86 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>