More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6457 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6457  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0357  OmpA/MotB  64.17 
 
 		 187 aa  234  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  34.83 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  32.87 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  39 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  35.85 
 
 		 350 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  35.85 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  35.85 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  41.96 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  41.12 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  35.85 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  35.85 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  35.85 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  41.96 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  35.85 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  41.96 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  35.85 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  34.17 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  35.85 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  34.17 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.78 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4195  peptidoglycan-associated lipoprotein  38 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  34.17 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  36.51 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1223  peptidoglycan-associated lipoprotein OprL  38 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1252  peptidoglycan-associated lipoprotein  38 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0470873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  35.62 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3992  peptidoglycan-associated lipoprotein  38 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  33.05 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4401  OmpA/MotB  38 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  39.78 
 
 		 225 aa  62  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  38.33 
 
 		 351 aa  62.4  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 222 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.19 
 
 		 222 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 477 aa  62  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  39.39 
 
 		 231 aa  62  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  36.19 
 
 		 222 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  34.58 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  34.58 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 222 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3971  peptidoglycan-associated lipoprotein  37 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  34.58 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1416  OmpA/MotB  37 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0389621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  34.58 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  34.58 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  34.58 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  36.79 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  34.58 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  34.58 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  31.75 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  37.74 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2528  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.72 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139934  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  39.56 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  36.78 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  38.68 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  37 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  37 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  37 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  36.63 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  39.53 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  39.56 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  39.56 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  33.33 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2278  OmpA/MotB domain-containing protein  37 
 
 		 373 aa  58.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  35.63 
 
 		 358 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  35.63 
 
 		 358 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  35.63 
 
 		 371 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  37.62 
 
 		 320 aa  58.5  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  36.63 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  35.63 
 
 		 369 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  36.63 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  39.53 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  36.05 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  32.48 
 
 		 294 aa  58.2  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  33.88 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  35.25 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  39.66 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  36.78 
 
 		 354 aa  57.8  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  39.53 
 
 		 366 aa  57.8  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.19 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 220 aa  57  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  39.53 
 
 		 361 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>