More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4096 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4096  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 180 aa  340  5e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287994  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  39.32 
 
 		 252 aa  88.2  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  37.41 
 
 		 217 aa  87.8  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  39.2 
 
 		 430 aa  85.9  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  48.84 
 
 		 233 aa  84.3  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  38.71 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2977  OmpA/MotB domain protein  47.75 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.64 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  43.33 
 
 		 560 aa  77  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7252  OmpA/MotB domain-containing protein  41.5 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  42.19 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  40.16 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  38.33 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  39.04 
 
 		 355 aa  74.7  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.16 
 
 		 239 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  40.31 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  39.83 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  41.8 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  41.8 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  38.24 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3892  OmpA/MotB domain protein  40.34 
 
 		 365 aa  72  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309252  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 		 679 aa  71.6  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 362 aa  71.2  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  41.38 
 
 		 200 aa  70.9  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  37.5 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  32.26 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  41.74 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  41.74 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  33.59 
 
 		 366 aa  68.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  39.29 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  40.87 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  38.05 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  33.61 
 
 		 236 aa  67.8  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  37.72 
 
 		 350 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  39.13 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  38.14 
 
 		 218 aa  67  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1203  OmpA/MotB domain-containing protein  41.56 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.232705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  37.72 
 
 		 350 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  38.6 
 
 		 351 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  37.7 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  35.77 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  36.52 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  38.94 
 
 		 327 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  37.72 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  38.33 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  35.71 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  39.13 
 
 		 344 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  39.13 
 
 		 344 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  35.19 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  39.13 
 
 		 344 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  32.58 
 
 		 499 aa  65.1  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1463  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.373103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  40.37 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  30 
 
 		 648 aa  65.1  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  41.32 
 
 		 477 aa  65.1  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.72 
 
 		 344 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  36.59 
 
 		 352 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  31.47 
 
 		 356 aa  64.7  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0682  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 		 439 aa  64.7  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  37.7 
 
 		 260 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  35.83 
 
 		 263 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  36.94 
 
 		 320 aa  64.3  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  37.4 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  36 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  36.84 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  31.36 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  38.26 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  35.48 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  41.88 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0318  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0137068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  42.27 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  42.27 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  36.52 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  30.6 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1564  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.17 
 
 		 521 aa  62.4  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0620  OmpA/MotB  41.6 
 
 		 572 aa  62.4  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  46.51 
 
 		 1755 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  38.32 
 
 		 321 aa  62  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  35.65 
 
 		 288 aa  62  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.45 
 
 		 407 aa  62  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1340  Outer membrane protein and related peptidoglycan- associated (lipo)protein-like protein  40 
 
 		 535 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.298115 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  38.21 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  35.77 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.5 
 
 		 220 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  32.58 
 
 		 231 aa  62  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  26.86 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  35.77 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  38.98 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>