More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1730 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1730  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 322 aa  664    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.262216  normal  0.802647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4097  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386824  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2790  OmpA/MotB domain-containing protein  29.05 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09021  putative outer membrane protein  23.23 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111928  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  37.59 
 
 		 352 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  45.12 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  44.19 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  35.88 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  33.76 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  45.12 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  45.68 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  34.13 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  43.9 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  45.68 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  43.01 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  40.66 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  51.43 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  43.9 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  46.34 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  46.34 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  28.72 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1358  OmpA/MotB  34.67 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000545475  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  32.93 
 
 		 440 aa  72.8  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  46.34 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  43.53 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  45 
 
 		 205 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  44.3 
 
 		 229 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 623 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  35.87 
 
 		 498 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  45.57 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  45 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  35.19 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  43.21 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.51 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  38.98 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  38.98 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  44.3 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  38.98 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  36.67 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  32.76 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  45.12 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  43.75 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  29.11 
 
 		 638 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  43.9 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  52.17 
 
 		 165 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  36.7 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  32.58 
 
 		 558 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  33.96 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  37.96 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  37.96 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  43.16 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  41.86 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  41.86 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  38.3 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  40.74 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  39.77 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  34.83 
 
 		 542 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  34.83 
 
 		 558 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  34.83 
 
 		 558 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  40.7 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  39.24 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  39.51 
 
 		 648 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  50.75 
 
 		 172 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  43.9 
 
 		 344 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  35.56 
 
 		 212 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  38.04 
 
 		 402 aa  67  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  45.83 
 
 		 159 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  45.83 
 
 		 168 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  34.84 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  40.74 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  35.4 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  42.68 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  41.25 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  39.24 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0587  outer membrane protein, OmpA family  37.14 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  36.61 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  43.53 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  43.04 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  34.19 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  34.83 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  49.28 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  39.02 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02232  hypothetical protein  40.7 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  39.76 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  47.83 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  40.24 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  36.96 
 
 		 533 aa  65.9  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  39.24 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  42.86 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  31.48 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260064  normal  0.0786224 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  34.07 
 
 		 575 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  31.48 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  34.19 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  47.89 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  41.57 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  39.76 
 
 		 224 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>