More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4097 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4097  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 285 aa  583  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386824  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1730  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 322 aa  165  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.262216  normal  0.802647 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2790  OmpA/MotB domain-containing protein  30.49 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  41.75 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  40 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  49.37 
 
 		 217 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  49.37 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  44.44 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  45.12 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  38.14 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  38.71 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  34.71 
 
 		 510 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  39.58 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  46.38 
 
 		 224 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1604  OmpA family protein  31.25 
 
 		 558 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.395642  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0155  OmpA family protein  31.25 
 
 		 558 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  34.69 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  39.25 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0120  hypothetical protein  34.51 
 
 		 558 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0131  OmpA family protein  32.5 
 
 		 542 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  30.51 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  34.86 
 
 		 537 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  39.02 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  34.58 
 
 		 586 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  40.51 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  41.46 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  32.54 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0237  OmpA/MotB  35.71 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.064428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  37.62 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 		 374 aa  69.3  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  37.5 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  30 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  35.45 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  36.26 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  38.18 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  41.46 
 
 		 217 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  26.37 
 
 		 1793 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  37.5 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  37.5 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  38.18 
 
 		 210 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  33.67 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  30.07 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  33.96 
 
 		 623 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  44.05 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.77 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.51 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  34.23 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  32.77 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  46.25 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  33.67 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  47.83 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  31.85 
 
 		 533 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  36.27 
 
 		 331 aa  67  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  29.33 
 
 		 228 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  44.16 
 
 		 205 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  30.14 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  31.85 
 
 		 533 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  29.66 
 
 		 464 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  41.77 
 
 		 670 aa  67  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  37.86 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  35.87 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  30.51 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4248  OmpA/MotB domain-containing protein  43.06 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000908263  unclonable  0.0000000127118 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  29.52 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1344  OmpA/MotB domain-containing protein  43.9 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124071  hitchhiker  0.0000223206 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  37.8 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  41.98 
 
 		 478 aa  66.2  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  38.75 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  40.22 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  32.76 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 498 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  33.96 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  34.23 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  29.01 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  44.93 
 
 		 445 aa  65.9  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  35.56 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  37.21 
 
 		 631 aa  65.9  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  38.89 
 
 		 710 aa  65.9  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  39.24 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  33.67 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  41.49 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  44.3 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  36.08 
 
 		 219 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  30.58 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  30.83 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  32.85 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  41.49 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  39.33 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  32.48 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  38.16 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>