18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4633 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4633  putative periplasmic protein  100 
 
 		 274 aa  563  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396261  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5405  hypothetical protein  59.85 
 
 		 322 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6671  putative periplasmic protein  59.62 
 
 		 258 aa  285  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0882  hypothetical protein  31.75 
 
 		 264 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2755  hypothetical protein  31.7 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2124  hypothetical protein  27.87 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2171  putative periplasmic protein  27.87 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1454  hypothetical protein  30.6 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324285  hitchhiker  0.000084919 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0408  hypothetical protein  29.11 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5056  hypothetical protein  29.15 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3839  hypothetical protein  31.36 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3516  hypothetical protein  26.67 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1468  hypothetical protein  28.85 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0585  hypothetical protein  26.84 
 
 		 271 aa  95.1  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.777226 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  26.98 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4532  periplasmic protein-like protein  26.67 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2141  periplasmic protein-like protein  23.98 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1239  hypothetical protein  25.56 
 
 		 369 aa  46.2  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00785292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>