17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0585 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0585  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  555  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.777226 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1454  hypothetical protein  50.96 
 
 
275 aa  288  6e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324285  hitchhiker  0.000084919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1468  hypothetical protein  39.03 
 
 
278 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0408  hypothetical protein  30.86 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5056  hypothetical protein  31.58 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3839  hypothetical protein  27.38 
 
 
253 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2171  putative periplasmic protein  24.9 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2124  hypothetical protein  24.9 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5405  hypothetical protein  26.52 
 
 
322 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016465  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4633  putative periplasmic protein  27.8 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396261  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0882  hypothetical protein  23.89 
 
 
264 aa  87  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6671  putative periplasmic protein  30.37 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2755  hypothetical protein  25.21 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  26.29 
 
 
420 aa  72.4  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3516  hypothetical protein  26.56 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2141  periplasmic protein-like protein  26.29 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4532  periplasmic protein-like protein  22.96 
 
 
291 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>