17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2141 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2141  periplasmic protein-like protein  100 
 
 
308 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4532  periplasmic protein-like protein  51.24 
 
 
291 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5056  hypothetical protein  30.14 
 
 
260 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3839  hypothetical protein  27.98 
 
 
253 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2171  putative periplasmic protein  23.7 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2124  hypothetical protein  23.7 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2755  hypothetical protein  27.7 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0408  hypothetical protein  25 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0882  hypothetical protein  25.54 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0585  hypothetical protein  25.91 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.777226 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1454  hypothetical protein  25 
 
 
275 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324285  hitchhiker  0.000084919 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5405  hypothetical protein  24.43 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016465  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  26.1 
 
 
420 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4633  putative periplasmic protein  24.58 
 
 
274 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396261  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3516  hypothetical protein  26.95 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1468  hypothetical protein  21.61 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6671  putative periplasmic protein  25.29 
 
 
258 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>