17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4532 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4532  periplasmic protein-like protein  100 
 
 
291 aa  590  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2141  periplasmic protein-like protein  60.73 
 
 
308 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3839  hypothetical protein  28.37 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5056  hypothetical protein  29.17 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2171  putative periplasmic protein  27.96 
 
 
268 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2124  hypothetical protein  27.96 
 
 
268 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0408  hypothetical protein  29.33 
 
 
255 aa  89.4  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1468  hypothetical protein  26.44 
 
 
278 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5405  hypothetical protein  26.56 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016465  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4633  putative periplasmic protein  26.73 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396261  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6671  putative periplasmic protein  26.02 
 
 
258 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0882  hypothetical protein  24.26 
 
 
264 aa  62.8  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1454  hypothetical protein  24.26 
 
 
275 aa  62.4  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324285  hitchhiker  0.000084919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2755  hypothetical protein  25.79 
 
 
269 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0585  hypothetical protein  23.5 
 
 
271 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.777226 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  24.68 
 
 
420 aa  49.3  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3516  hypothetical protein  24.39 
 
 
262 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>