17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6671 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6671  putative periplasmic protein  100 
 
 
258 aa  526  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4633  putative periplasmic protein  59.74 
 
 
274 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396261  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5405  hypothetical protein  53.46 
 
 
322 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016465  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5056  hypothetical protein  29.92 
 
 
260 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0882  hypothetical protein  31.19 
 
 
264 aa  113  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2755  hypothetical protein  29.71 
 
 
269 aa  109  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0408  hypothetical protein  32.59 
 
 
255 aa  106  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2171  putative periplasmic protein  26.48 
 
 
268 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2124  hypothetical protein  26.48 
 
 
268 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1454  hypothetical protein  28.4 
 
 
275 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324285  hitchhiker  0.000084919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3839  hypothetical protein  28.38 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1468  hypothetical protein  25.61 
 
 
278 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0585  hypothetical protein  28.03 
 
 
271 aa  85.1  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.777226 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3516  hypothetical protein  26.5 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  25.29 
 
 
420 aa  72.4  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4532  periplasmic protein-like protein  26.83 
 
 
291 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2141  periplasmic protein-like protein  25.27 
 
 
308 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.868901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>