195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0689 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0689  YD repeat protein  100 
 
 		 1531 aa  3104    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  31.35 
 
 		 2046 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1834  YD repeat-containing protein  30.08 
 
 		 2038 aa  373  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  30.43 
 
 		 2113 aa  325  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3428  YD repeat protein  31.35 
 
 		 2585 aa  273  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.968597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3427  YD repeat-containing protein  34.02 
 
 		 451 aa  119  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  29.55 
 
 		 2447 aa  119  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15150  hypothetical protein  31.77 
 
 		 577 aa  113  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0439541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0948  YD repeat protein  28.83 
 
 		 2215 aa  90.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.784395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.36 
 
 		 2096 aa  81.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.39 
 
 		 1600 aa  76.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  23.94 
 
 		 1271 aa  75.5  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  22.1 
 
 		 1669 aa  75.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  20.93 
 
 		 1840 aa  73.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.69 
 
 		 1942 aa  73.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  25.31 
 
 		 869 aa  72  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  28.28 
 
 		 1464 aa  72  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.22 
 
 		 2035 aa  70.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  22.33 
 
 		 1917 aa  70.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  28.05 
 
 		 3273 aa  70.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  23.54 
 
 		 1732 aa  69.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  25.75 
 
 		 2277 aa  69.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0467  YD repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1081 aa  68.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  25.92 
 
 		 1579 aa  68.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  25.92 
 
 		 1428 aa  68.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  26.79 
 
 		 1602 aa  66.6  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1547 aa  65.9  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  22.66 
 
 		 1959 aa  64.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  25.92 
 
 		 613 aa  64.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.45 
 
 		 1528 aa  63.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  28.33 
 
 		 1485 aa  63.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  27.09 
 
 		 1388 aa  62.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  32.22 
 
 		 1539 aa  62.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00947  putative RHS-related protein  27.24 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  22.83 
 
 		 3027 aa  62  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1405 aa  62  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_003296  RS00945  rhs-related protein  27.34 
 
 		 587 aa  62  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  32.22 
 
 		 1539 aa  62  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0468  YD repeat-containing protein  26.35 
 
 		 1090 aa  60.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.32 
 
 		 2149 aa  60.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  29.36 
 
 		 2075 aa  60.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  30.51 
 
 		 1560 aa  59.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  25.08 
 
 		 1434 aa  59.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  30.6 
 
 		 738 aa  58.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  23.88 
 
 		 3193 aa  58.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2470  rhs-related protein  25.37 
 
 		 890 aa  58.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  25.09 
 
 		 1485 aa  58.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  28.68 
 
 		 1390 aa  57.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  29.74 
 
 		 2003 aa  57.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  23.92 
 
 		 1576 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  29.18 
 
 		 1508 aa  57.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  26.23 
 
 		 1046 aa  57.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.08 
 
 		 1527 aa  57  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  27.78 
 
 		 1626 aa  57  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.38 
 
 		 1520 aa  57  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  26.27 
 
 		 1488 aa  56.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  37.23 
 
 		 1953 aa  56.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  29.95 
 
 		 1554 aa  56.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2826  substrate-binding repeat-containing protein  30.86 
 
 		 419 aa  56.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  26.27 
 
 		 1405 aa  55.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.16 
 
 		 1467 aa  55.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.08 
 
 		 1550 aa  55.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  24.17 
 
 		 1398 aa  55.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  28.63 
 
 		 1415 aa  55.5  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  24.74 
 
 		 1259 aa  54.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  28.39 
 
 		 1317 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  22.73 
 
 		 1053 aa  55.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  24.74 
 
 		 1583 aa  55.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  26.44 
 
 		 1509 aa  54.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  25.07 
 
 		 1268 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  24.04 
 
 		 2486 aa  54.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  26.79 
 
 		 1517 aa  54.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1191  YD repeat-containing protein  31.79 
 
 		 425 aa  53.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  26.19 
 
 		 1429 aa  54.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.08 
 
 		 1551 aa  54.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3796  YD repeat-containing protein  27.67 
 
 		 422 aa  53.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.982597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  26.44 
 
 		 1528 aa  54.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  24.31 
 
 		 2942 aa  53.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  24.46 
 
 		 924 aa  54.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  27.6 
 
 		 1525 aa  53.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1046  YD repeat protein  25.25 
 
 		 902 aa  54.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101993  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  26.01 
 
 		 1426 aa  53.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  27.15 
 
 		 1609 aa  53.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  25.76 
 
 		 2416 aa  53.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  25.62 
 
 		 1426 aa  53.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  27.6 
 
 		 1466 aa  53.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  25.81 
 
 		 1998 aa  53.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  24.29 
 
 		 1446 aa  53.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  28.99 
 
 		 1348 aa  53.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  24.44 
 
 		 1400 aa  53.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.2 
 
 		 1197 aa  53.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.05 
 
 		 1492 aa  53.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1426 aa  53.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1230  YD repeat protein  25.46 
 
 		 2191 aa  53.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249326 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  28.29 
 
 		 1352 aa  53.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  24.84 
 
 		 1586 aa  53.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1216 aa  52.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  24.44 
 
 		 1200 aa  52.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  22.84 
 
 		 1572 aa  52.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  28.95 
 
 		 1543 aa  52.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>