23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3258 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3258  hypothetical protein  100 
 
 		 930 aa  1893    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339134  normal  0.438308 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0956  hypothetical protein  27.58 
 
 		 594 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.194018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3124  hypothetical protein  31.13 
 
 		 361 aa  109  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3336  hypothetical protein  30.83 
 
 		 396 aa  94.4  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0622  hypothetical protein  28.12 
 
 		 371 aa  89  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1491  hypothetical protein  29.62 
 
 		 370 aa  86.3  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7052  hypothetical protein  26.55 
 
 		 373 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1706  hypothetical protein  28.09 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1790  hypothetical protein  25.54 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4615  hypothetical protein  26.96 
 
 		 363 aa  79.7  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0234  hypothetical protein  26.85 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0057  hypothetical protein  29.48 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2768  hypothetical protein  27.56 
 
 		 361 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  34.48 
 
 		 2031 aa  70.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2835  hypothetical protein  26.86 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1697  hypothetical protein  28.23 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2312  hypothetical protein  23.39 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.243961  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4520  hypothetical protein  23.32 
 
 		 541 aa  63.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0874605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0526  hypothetical protein  25.76 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07098  hypothetical protein  30.71 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  30.81 
 
 		 1307 aa  52.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  34.83 
 
 		 649 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  32.29 
 
 		 743 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>