49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4511 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4511  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 341 aa  679    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  35.28 
 
 		 505 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4087  glycoside hydrolase family 43  29.23 
 
 		 357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  31 
 
 		 456 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  31.53 
 
 		 369 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  26.49 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  26.77 
 
 		 306 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  27.06 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  24.54 
 
 		 501 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  27.18 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  25.41 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  23.6 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  27.53 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 532 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  24.78 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  23.88 
 
 		 560 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  27.72 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.98 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.53 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  26.12 
 
 		 524 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.52 
 
 		 346 aa  50.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  27.01 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  25.3 
 
 		 315 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  28.4 
 
 		 337 aa  49.7  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  26.19 
 
 		 340 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.42 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  23.57 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 		 465 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  21.08 
 
 		 325 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  21.93 
 
 		 380 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.84 
 
 		 357 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.64 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  23.83 
 
 		 512 aa  46.6  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  27.5 
 
 		 524 aa  46.6  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  26.36 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.03 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.9 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.55 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  29.03 
 
 		 618 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.55 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  26.72 
 
 		 509 aa  43.5  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  28.06 
 
 		 376 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  21.83 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.88 
 
 		 319 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  27.14 
 
 		 393 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>