29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4087 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4087  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 357 aa  731    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4511  glycoside hydrolase family protein  29.19 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  31.4 
 
 		 369 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  25.97 
 
 		 505 aa  86.3  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  28.83 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4281  glycoside hydrolase family protein  31.89 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394059  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  29.48 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  25.63 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  29.39 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  28.16 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  24.67 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  24.62 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3976  glycoside hydrolase family protein  29.12 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25.08 
 
 		 522 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  25.39 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  23.24 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.6 
 
 		 495 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.12 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.66 
 
 		 343 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  29.39 
 
 		 337 aa  49.7  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  25.31 
 
 		 341 aa  46.6  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  25.69 
 
 		 536 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  30.05 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  25.52 
 
 		 524 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  27.78 
 
 		 323 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  29.12 
 
 		 393 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  24.22 
 
 		 325 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  24.64 
 
 		 491 aa  43.5  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  21.07 
 
 		 501 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>