More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_37797 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_04102  beta-glucosidase (Eurofung)  43.74 
 
 		 854 aa  635    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37797  beta-glucosidase  100 
 
 		 814 aa  1681    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.472931 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10482  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  43.6 
 
 		 868 aa  602  1.0000000000000001e-171  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.584678 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06652  beta-glucosidase (Eurofung)  39.95 
 
 		 1023 aa  558  1e-157  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  43.43 
 
 		 819 aa  501  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  42.76 
 
 		 737 aa  458  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475054 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  35.64 
 
 		 772 aa  455  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151913 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  38.33 
 
 		 822 aa  408  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.44 
 
 		 749 aa  251  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.44 
 
 		 758 aa  251  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  32.75 
 
 		 750 aa  251  5e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  32.64 
 
 		 733 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  32.64 
 
 		 733 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  32.64 
 
 		 733 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.85 
 
 		 755 aa  248  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  33.39 
 
 		 693 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  32.38 
 
 		 733 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  33.23 
 
 		 733 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  31.66 
 
 		 755 aa  242  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  28.7 
 
 		 717 aa  238  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.77 
 
 		 1072 aa  238  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  30.74 
 
 		 722 aa  238  4e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  32.03 
 
 		 733 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  31.62 
 
 		 733 aa  237  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.81 
 
 		 933 aa  235  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  32.43 
 
 		 931 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  28.79 
 
 		 793 aa  235  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.28 
 
 		 790 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  28.64 
 
 		 793 aa  234  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  30.48 
 
 		 721 aa  234  6e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.66 
 
 		 711 aa  233  9e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  30.19 
 
 		 735 aa  231  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  28.44 
 
 		 714 aa  231  4e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  31.23 
 
 		 762 aa  231  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  32.5 
 
 		 987 aa  230  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  31.03 
 
 		 740 aa  227  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.39 
 
 		 757 aa  226  9e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  30.89 
 
 		 922 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  29.08 
 
 		 814 aa  225  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  31.82 
 
 		 748 aa  223  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  28.88 
 
 		 708 aa  222  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  31.31 
 
 		 748 aa  222  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  30.32 
 
 		 731 aa  221  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  30.57 
 
 		 731 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  29.58 
 
 		 701 aa  220  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  28.09 
 
 		 745 aa  219  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.75 
 
 		 757 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  28.82 
 
 		 685 aa  215  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  27.88 
 
 		 721 aa  214  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.83 
 
 		 734 aa  213  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  28.86 
 
 		 747 aa  211  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07915  beta-glucosidase (Eurofung)  33.27 
 
 		 812 aa  210  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  30.53 
 
 		 749 aa  207  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  28.08 
 
 		 716 aa  206  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  30.14 
 
 		 800 aa  204  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  28.91 
 
 		 731 aa  204  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.19 
 
 		 1321 aa  204  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.38 
 
 		 748 aa  202  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  31.47 
 
 		 730 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  31.2 
 
 		 731 aa  201  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.46 
 
 		 1158 aa  200  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  28.24 
 
 		 737 aa  200  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  29.81 
 
 		 1338 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  30.23 
 
 		 737 aa  197  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  28.13 
 
 		 741 aa  197  8.000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  28.68 
 
 		 760 aa  197  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  28.81 
 
 		 738 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  30.84 
 
 		 691 aa  191  5.999999999999999e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  30.38 
 
 		 779 aa  187  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03949  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  31.38 
 
 		 670 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.93 
 
 		 813 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.63 
 
 		 756 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  26.42 
 
 		 829 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.12 
 
 		 737 aa  185  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  30.57 
 
 		 850 aa  184  6e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  26.35 
 
 		 757 aa  182  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.07 
 
 		 724 aa  181  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.86 
 
 		 780 aa  181  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.78 
 
 		 758 aa  180  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.2 
 
 		 750 aa  179  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  28.62 
 
 		 805 aa  179  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  31.16 
 
 		 823 aa  177  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  24.91 
 
 		 874 aa  172  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.37 
 
 		 814 aa  172  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  28.62 
 
 		 809 aa  172  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.16 
 
 		 820 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  31.38 
 
 		 851 aa  170  1e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  29 
 
 		 831 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  31.1 
 
 		 843 aa  166  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  30.37 
 
 		 833 aa  166  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2110  glycoside hydrolase family protein  39.53 
 
 		 894 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.2 
 
 		 746 aa  165  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  36.05 
 
 		 836 aa  165  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  28.67 
 
 		 843 aa  164  4.0000000000000004e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  27.53 
 
 		 755 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  31.08 
 
 		 914 aa  162  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.31 
 
 		 777 aa  162  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  27.43 
 
 		 765 aa  161  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  27.49 
 
 		 772 aa  161  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  27.27 
 
 		 765 aa  160  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>