87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13010 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 445 aa  907    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  55.66 
 
 		 431 aa  487  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  50.35 
 
 		 429 aa  435  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  49.53 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  50.23 
 
 		 429 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  46.62 
 
 		 452 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  39.63 
 
 		 435 aa  331  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  44.39 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  41.56 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  37.57 
 
 		 538 aa  241  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  33.42 
 
 		 415 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  33.73 
 
 		 473 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  31.1 
 
 		 479 aa  205  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  35 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  32.15 
 
 		 408 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  29.88 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  31.86 
 
 		 627 aa  190  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  31.52 
 
 		 596 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  32.51 
 
 		 479 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  27.73 
 
 		 581 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  32.14 
 
 		 473 aa  179  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  33.91 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  30.67 
 
 		 485 aa  176  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  29.97 
 
 		 464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  29.77 
 
 		 494 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  35.17 
 
 		 674 aa  167  2.9999999999999998e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  30 
 
 		 479 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  29.8 
 
 		 711 aa  163  7e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  35.22 
 
 		 474 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  31.29 
 
 		 450 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  29.9 
 
 		 446 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  32.48 
 
 		 446 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  27.23 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  29.68 
 
 		 474 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  29.4 
 
 		 478 aa  151  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  26.59 
 
 		 473 aa  145  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  30.91 
 
 		 447 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  28.61 
 
 		 731 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  29.83 
 
 		 471 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  25.78 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  28.92 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  27.82 
 
 		 482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  28.61 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  28.89 
 
 		 532 aa  130  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  27.13 
 
 		 644 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  25.63 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.57 
 
 		 467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.45 
 
 		 688 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  26.32 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  29.49 
 
 		 606 aa  110  7.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  28.92 
 
 		 463 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.36 
 
 		 698 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  30.4 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  33.76 
 
 		 212 aa  105  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.69 
 
 		 709 aa  105  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  25.29 
 
 		 537 aa  104  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.06 
 
 		 687 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  27.68 
 
 		 750 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  27.23 
 
 		 466 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  27.76 
 
 		 932 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  27.87 
 
 		 638 aa  100  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  24.89 
 
 		 798 aa  99  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  28.22 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  25.71 
 
 		 690 aa  96.7  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  27.11 
 
 		 483 aa  96.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  28.35 
 
 		 581 aa  93.6  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.65 
 
 		 704 aa  92.4  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  21.89 
 
 		 534 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.43 
 
 		 487 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  28.37 
 
 		 470 aa  90.9  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  32.81 
 
 		 704 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  23.82 
 
 		 663 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  25.47 
 
 		 516 aa  83.6  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  25.46 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  25.39 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  32.61 
 
 		 505 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  31.54 
 
 		 606 aa  76.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  24.93 
 
 		 486 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  31.54 
 
 		 584 aa  75.1  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  31.34 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  32.31 
 
 		 515 aa  73.6  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  27.97 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  27.68 
 
 		 555 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1302  glycoside hydrolase family alpha-L-fucosidase  30.77 
 
 		 540 aa  53.9  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.186001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5083  hypothetical protein  29.5 
 
 		 715 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365257  normal  0.435002 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0640  F5/8 type C domain-containing protein  19.26 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0652  F5/8 type C domain-containing protein  19.63 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0313432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>