79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3569 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 515 aa  1033    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  57.85 
 
 		 466 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  54.98 
 
 		 464 aa  532  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  49.07 
 
 		 505 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  50.42 
 
 		 484 aa  491  1e-137  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  46.31 
 
 		 537 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  48.37 
 
 		 532 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  45.9 
 
 		 584 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  45.66 
 
 		 606 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  43.52 
 
 		 495 aa  443  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  38.32 
 
 		 534 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  39.47 
 
 		 798 aa  304  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  38.85 
 
 		 516 aa  294  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  33.78 
 
 		 555 aa  287  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  34.38 
 
 		 486 aa  280  5e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  35.88 
 
 		 663 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1302  glycoside hydrolase family alpha-L-fucosidase  34.7 
 
 		 540 aa  266  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.186001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  37.78 
 
 		 483 aa  263  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  32.57 
 
 		 731 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  32.07 
 
 		 473 aa  207  5e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  30.71 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  30.22 
 
 		 446 aa  201  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  37.37 
 
 		 490 aa  193  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  30.89 
 
 		 463 aa  194  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  29.52 
 
 		 482 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  32.44 
 
 		 500 aa  184  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  32.2 
 
 		 471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  32.16 
 
 		 478 aa  181  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  29.29 
 
 		 492 aa  177  5e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  31.51 
 
 		 474 aa  151  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  26.87 
 
 		 627 aa  146  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  28.73 
 
 		 435 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  25.97 
 
 		 479 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  30.59 
 
 		 464 aa  136  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  28.71 
 
 		 596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  27.42 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  25.8 
 
 		 581 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  25.96 
 
 		 473 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  29.4 
 
 		 538 aa  119  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  28.87 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  27.07 
 
 		 441 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  24.95 
 
 		 479 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  25.5 
 
 		 446 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  25.79 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  29.62 
 
 		 674 aa  106  8e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  25.6 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  26.05 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  26.12 
 
 		 450 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  23.74 
 
 		 711 aa  100  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  25.33 
 
 		 494 aa  100  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  30 
 
 		 212 aa  97.4  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  24.17 
 
 		 429 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  25.4 
 
 		 478 aa  97.1  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  22.65 
 
 		 415 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  26.84 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  29.51 
 
 		 340 aa  89  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  21.67 
 
 		 452 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  26.61 
 
 		 474 aa  88.2  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  35.38 
 
 		 644 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  29.94 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  32.31 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  28.1 
 
 		 473 aa  70.5  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  29.46 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  25.3 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  26.96 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  25.91 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  25.91 
 
 		 460 aa  57  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  24.48 
 
 		 410 aa  57  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  23.34 
 
 		 932 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  23.61 
 
 		 750 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  32.29 
 
 		 704 aa  50.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.43 
 
 		 709 aa  50.4  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.17 
 
 		 688 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.13 
 
 		 687 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.18 
 
 		 467 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  22.58 
 
 		 638 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  20.89 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  34.67 
 
 		 606 aa  45.4  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  32 
 
 		 690 aa  43.9  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>