83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0308 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 463 aa  964    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  46.9 
 
 		 932 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  49.22 
 
 		 750 aa  455  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.75 
 
 		 688 aa  442  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  46.12 
 
 		 690 aa  436  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.86 
 
 		 687 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  48.78 
 
 		 606 aa  419  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.8 
 
 		 698 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  42.33 
 
 		 704 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  43.6 
 
 		 470 aa  385  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.6 
 
 		 704 aa  376  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  41.45 
 
 		 638 aa  345  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.53 
 
 		 487 aa  336  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.01 
 
 		 709 aa  305  2.0000000000000002e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  38.82 
 
 		 434 aa  296  7e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  42.12 
 
 		 410 aa  290  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  38.37 
 
 		 581 aa  290  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  35.05 
 
 		 460 aa  280  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  35.05 
 
 		 460 aa  280  4e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0640  F5/8 type C domain-containing protein  29.52 
 
 		 436 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0652  F5/8 type C domain-containing protein  29.75 
 
 		 436 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0313432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.83 
 
 		 467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  32.06 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  32.4 
 
 		 581 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  32.61 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  26.26 
 
 		 538 aa  113  7.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  28.92 
 
 		 445 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  28.52 
 
 		 473 aa  106  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  30.21 
 
 		 447 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  28.62 
 
 		 450 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  29.29 
 
 		 596 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  36.59 
 
 		 674 aa  102  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  27.36 
 
 		 435 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  27.09 
 
 		 429 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  27.51 
 
 		 452 aa  99.8  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  27.27 
 
 		 340 aa  97.8  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  27.8 
 
 		 440 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  27.39 
 
 		 473 aa  96.7  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  27.48 
 
 		 479 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  25.89 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  26.03 
 
 		 431 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  27.11 
 
 		 471 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  29.28 
 
 		 478 aa  91.7  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  35.14 
 
 		 711 aa  92.4  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  29.24 
 
 		 485 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  25.91 
 
 		 474 aa  90.1  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  27.4 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  30.88 
 
 		 446 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  34.04 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  26.54 
 
 		 627 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  22.68 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  28.52 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  38 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  32.37 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  31.05 
 
 		 490 aa  77.4  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  26.76 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  26.34 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  25.45 
 
 		 644 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  24.57 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  26.56 
 
 		 484 aa  69.3  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  27.59 
 
 		 731 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  26.52 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  26.53 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  26.85 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  26.72 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  23.05 
 
 		 532 aa  58.9  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  36.49 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  36.84 
 
 		 495 aa  53.9  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  23.51 
 
 		 483 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  27.74 
 
 		 486 aa  53.5  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  37.84 
 
 		 478 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  26.41 
 
 		 464 aa  53.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  24.44 
 
 		 492 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  34.67 
 
 		 606 aa  50.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  23.66 
 
 		 473 aa  50.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  34.67 
 
 		 584 aa  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  29.69 
 
 		 663 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.29 
 
 		 1967 aa  48.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  27.64 
 
 		 500 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  37.18 
 
 		 474 aa  47.4  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  20.89 
 
 		 515 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  30.67 
 
 		 537 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>