44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0640 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0652  F5/8 type C domain-containing protein  97.94 
 
 		 436 aa  843    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0313432  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0640  F5/8 type C domain-containing protein  100 
 
 		 436 aa  877    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  32.88 
 
 		 932 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  32.82 
 
 		 750 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  29.52 
 
 		 463 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  28.44 
 
 		 690 aa  197  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.05 
 
 		 688 aa  183  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  28.16 
 
 		 704 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.05 
 
 		 704 aa  177  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.35 
 
 		 487 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  26.52 
 
 		 606 aa  172  1e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.19 
 
 		 687 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.31 
 
 		 698 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  27.04 
 
 		 470 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  22.2 
 
 		 638 aa  152  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.9 
 
 		 709 aa  149  8e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  24.03 
 
 		 581 aa  142  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  25.06 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  24.46 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  20.62 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  20.38 
 
 		 460 aa  99  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.67 
 
 		 467 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  26.09 
 
 		 674 aa  73.9  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  32.41 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  22.71 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  18.69 
 
 		 429 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  19.26 
 
 		 445 aa  54.3  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  18.84 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  23.48 
 
 		 473 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  30.07 
 
 		 463 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  26.67 
 
 		 447 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  28.45 
 
 		 581 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  23.12 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  20.42 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  22.6 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  22.45 
 
 		 490 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  31.43 
 
 		 479 aa  46.6  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  22.56 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  17.82 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  25.52 
 
 		 450 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  26.76 
 
 		 711 aa  44.3  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  20.76 
 
 		 627 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  21.04 
 
 		 538 aa  43.5  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  20.49 
 
 		 408 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>