44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0652 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0652  F5/8 type C domain-containing protein  100 
 
 		 436 aa  879    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0313432  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0640  F5/8 type C domain-containing protein  97.94 
 
 		 436 aa  843    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  32.37 
 
 		 932 aa  255  8e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  32.59 
 
 		 750 aa  254  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  30.14 
 
 		 463 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  28.63 
 
 		 690 aa  198  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.73 
 
 		 688 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  28.38 
 
 		 704 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.14 
 
 		 704 aa  178  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.64 
 
 		 687 aa  173  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.07 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.73 
 
 		 698 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  26.09 
 
 		 606 aa  168  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  26.89 
 
 		 470 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  22.64 
 
 		 638 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.68 
 
 		 709 aa  149  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  24.29 
 
 		 581 aa  144  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  25.42 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  25.23 
 
 		 410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  20.85 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  20.76 
 
 		 460 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.44 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  26.71 
 
 		 674 aa  75.1  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  29.29 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  22.71 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  18.69 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  19.63 
 
 		 445 aa  53.5  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  24.29 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  28.45 
 
 		 581 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  26.67 
 
 		 447 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  18.84 
 
 		 429 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  31.62 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  23.12 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  21.28 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  20.45 
 
 		 479 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  22.6 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  22.77 
 
 		 538 aa  47.8  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  22.45 
 
 		 490 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  21.95 
 
 		 415 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  17.82 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  25.52 
 
 		 450 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  32.86 
 
 		 627 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  26.06 
 
 		 711 aa  43.9  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  23.94 
 
 		 446 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>