83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6474 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
467 aa  975    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  28.74 
 
 
690 aa  170  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  28.83 
 
 
463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.28 
 
 
698 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  28.42 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  29.14 
 
 
460 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  31.6 
 
 
441 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  32.27 
 
 
450 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  26.7 
 
 
932 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  31.33 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  26.36 
 
 
750 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  30.37 
 
 
435 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  25.99 
 
 
704 aa  137  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.65 
 
 
688 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  30.94 
 
 
431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.46 
 
 
709 aa  133  6.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  33 
 
 
434 aa  133  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  31.33 
 
 
452 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  30.43 
 
 
429 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  31.07 
 
 
410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  29 
 
 
440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  30.57 
 
 
445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.81 
 
 
704 aa  127  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.9 
 
 
487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  25.69 
 
 
606 aa  126  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  28.02 
 
 
447 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.37 
 
 
687 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  31.77 
 
 
581 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  25.51 
 
 
470 aa  123  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  31.25 
 
 
429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  27.51 
 
 
473 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  25.78 
 
 
581 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  25.79 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  27.49 
 
 
471 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  26.04 
 
 
538 aa  113  9e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  29.91 
 
 
638 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  27.53 
 
 
479 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  25.32 
 
 
711 aa  108  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  25.69 
 
 
485 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  26.51 
 
 
473 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  25.44 
 
 
479 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  27.16 
 
 
478 aa  103  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  26.47 
 
 
446 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  27.11 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  24.66 
 
 
474 aa  99  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  27.44 
 
 
494 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  26.6 
 
 
674 aa  96.7  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  24.64 
 
 
596 aa  94.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  27.83 
 
 
464 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0640  F5/8 type C domain-containing protein  22.67 
 
 
436 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0652  F5/8 type C domain-containing protein  22.27 
 
 
436 aa  90.1  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0313432  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  27.27 
 
 
408 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  24.07 
 
 
479 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  33.06 
 
 
627 aa  80.5  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  24.15 
 
 
644 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  37.4 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  37.4 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  23.44 
 
 
463 aa  66.6  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  30.65 
 
 
482 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  26 
 
 
474 aa  64.3  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  23.57 
 
 
534 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  23.16 
 
 
473 aa  61.6  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  30.17 
 
 
490 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  28.24 
 
 
484 aa  58.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  23 
 
 
505 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  24.54 
 
 
478 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  28 
 
 
532 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  23.02 
 
 
492 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  23.27 
 
 
495 aa  54.3  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  19.72 
 
 
483 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  34.41 
 
 
212 aa  53.9  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  22.6 
 
 
464 aa  53.5  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  22.29 
 
 
466 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  25.58 
 
 
584 aa  52.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  32.04 
 
 
1967 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  24.81 
 
 
606 aa  50.4  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  23.08 
 
 
798 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  19.94 
 
 
537 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  22.92 
 
 
663 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  23.42 
 
 
471 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  24.48 
 
 
500 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  25.17 
 
 
731 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  26.19 
 
 
515 aa  47.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>