84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2693 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 
479 aa  994    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  56.37 
 
 
473 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  39.91 
 
 
596 aa  329  7e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  39.59 
 
 
627 aa  290  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  35.39 
 
 
435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 
431 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  33.26 
 
 
441 aa  241  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  33.77 
 
 
440 aa  237  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  35.92 
 
 
435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  34.37 
 
 
452 aa  236  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  32.01 
 
 
429 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  34.16 
 
 
538 aa  220  5e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 
429 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  29.76 
 
 
464 aa  213  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  31.71 
 
 
446 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  30.69 
 
 
581 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  31.1 
 
 
445 aa  205  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  32.21 
 
 
415 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  30.84 
 
 
485 aa  192  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  31.44 
 
 
408 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  30.06 
 
 
473 aa  189  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  34.65 
 
 
450 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  28.67 
 
 
674 aa  183  7e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  28.18 
 
 
479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  30.79 
 
 
711 aa  179  7e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  33.24 
 
 
340 aa  179  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  29.52 
 
 
731 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  34.38 
 
 
478 aa  177  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  28.83 
 
 
471 aa  176  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  29.5 
 
 
479 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  30.71 
 
 
447 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  28.03 
 
 
494 aa  162  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  29.15 
 
 
463 aa  159  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  26.47 
 
 
537 aa  156  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  27.17 
 
 
446 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  27.01 
 
 
484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  28.14 
 
 
490 aa  147  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  27.63 
 
 
471 aa  147  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  26.95 
 
 
505 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  27.6 
 
 
478 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  28.32 
 
 
446 aa  143  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  26.17 
 
 
532 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  24.85 
 
 
584 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  27.24 
 
 
473 aa  137  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  27.29 
 
 
464 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  26.41 
 
 
515 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  23.94 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  26.96 
 
 
474 aa  133  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  27.32 
 
 
482 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  25.48 
 
 
492 aa  121  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  25.57 
 
 
644 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  26.81 
 
 
495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  23.81 
 
 
534 aa  114  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  25.73 
 
 
474 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  26.16 
 
 
500 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  26.07 
 
 
516 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  22.42 
 
 
798 aa  99  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  25.76 
 
 
932 aa  96.7  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  21.79 
 
 
486 aa  91.3  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  26.03 
 
 
750 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  23.59 
 
 
483 aa  91.3  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  29.1 
 
 
690 aa  85.5  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.54 
 
 
688 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  31.1 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.07 
 
 
467 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  29.57 
 
 
606 aa  83.2  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.88 
 
 
687 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  28.52 
 
 
463 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  22.09 
 
 
663 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  35.85 
 
 
470 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.75 
 
 
698 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  35.06 
 
 
704 aa  77.4  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  31.17 
 
 
606 aa  75.5  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.13 
 
 
709 aa  73.9  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1302  glycoside hydrolase family alpha-L-fucosidase  20.31 
 
 
540 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.186001 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  28.4 
 
 
212 aa  71.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  31.18 
 
 
555 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.35 
 
 
704 aa  67.8  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.21 
 
 
487 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  26.14 
 
 
460 aa  66.6  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  26.28 
 
 
460 aa  65.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  27.49 
 
 
410 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  23.99 
 
 
581 aa  63.5  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  23.34 
 
 
638 aa  60.1  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>