84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3264 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 471 aa  982    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  52.4 
 
 		 479 aa  532  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  51.99 
 
 		 473 aa  502  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  48.99 
 
 		 485 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  45.11 
 
 		 494 aa  449  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  44.31 
 
 		 479 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  36.1 
 
 		 450 aa  233  8.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  36.89 
 
 		 452 aa  209  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  36.31 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  35 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  33.98 
 
 		 431 aa  204  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  32.56 
 
 		 447 aa  200  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  31.37 
 
 		 415 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  30.48 
 
 		 581 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  33.99 
 
 		 435 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  34.91 
 
 		 429 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  29.05 
 
 		 440 aa  193  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  31.53 
 
 		 473 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  32.21 
 
 		 435 aa  186  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  31.29 
 
 		 446 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  31.64 
 
 		 538 aa  180  5.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  29.06 
 
 		 408 aa  176  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  28.83 
 
 		 479 aa  176  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  28.64 
 
 		 596 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  29.79 
 
 		 674 aa  165  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  29.51 
 
 		 464 aa  163  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  33.64 
 
 		 478 aa  161  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  27.45 
 
 		 731 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  29.75 
 
 		 711 aa  154  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  30.34 
 
 		 627 aa  143  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  27.19 
 
 		 463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  28.85 
 
 		 340 aa  136  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  26.34 
 
 		 482 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  26.97 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  25.81 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  24.17 
 
 		 490 aa  128  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  28.11 
 
 		 446 aa  126  7e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  29.28 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  26.11 
 
 		 474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  25.05 
 
 		 466 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  24.66 
 
 		 534 aa  120  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  26.59 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.49 
 
 		 467 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  27.12 
 
 		 473 aa  113  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  25.79 
 
 		 515 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  24.42 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  25.11 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  23.25 
 
 		 495 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  25.42 
 
 		 500 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  22.2 
 
 		 537 aa  99.8  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  24.4 
 
 		 532 aa  98.2  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  23.31 
 
 		 484 aa  97.1  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  28.42 
 
 		 410 aa  95.9  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  27.11 
 
 		 463 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  30.97 
 
 		 212 aa  92.8  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  22.81 
 
 		 486 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.9 
 
 		 709 aa  91.3  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  22.96 
 
 		 644 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  25.09 
 
 		 750 aa  90.1  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  25.88 
 
 		 470 aa  89.7  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  24.22 
 
 		 932 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  23.68 
 
 		 516 aa  86.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.71 
 
 		 688 aa  86.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  25 
 
 		 690 aa  85.5  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  26.17 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  26.81 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.09 
 
 		 687 aa  83.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  25.37 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.78 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.64 
 
 		 698 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  26.33 
 
 		 581 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  26.07 
 
 		 638 aa  77  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  26.82 
 
 		 505 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  28.65 
 
 		 606 aa  74.3  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  26.42 
 
 		 704 aa  74.3  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  21.3 
 
 		 663 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  19.3 
 
 		 798 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.23 
 
 		 704 aa  64.7  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  20.8 
 
 		 555 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  20.89 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  30.65 
 
 		 584 aa  62  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  30.65 
 
 		 606 aa  62  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1302  glycoside hydrolase family alpha-L-fucosidase  32 
 
 		 540 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.186001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>