83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2554 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 478 aa  979    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  87.47 
 
 		 471 aa  870    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  47.63 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  46.98 
 
 		 446 aa  390  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  39.58 
 
 		 731 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  43.62 
 
 		 474 aa  268  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  36.21 
 
 		 463 aa  246  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  34.24 
 
 		 490 aa  226  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  33.47 
 
 		 482 aa  221  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  34.07 
 
 		 464 aa  217  4e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  31.93 
 
 		 484 aa  207  3e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  31.6 
 
 		 505 aa  203  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  33.53 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  31.4 
 
 		 492 aa  190  5e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  31.79 
 
 		 473 aa  188  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  30.83 
 
 		 606 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  30.74 
 
 		 584 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  30.67 
 
 		 500 aa  184  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  31.94 
 
 		 515 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  29.84 
 
 		 534 aa  179  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  29.28 
 
 		 495 aa  178  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  29.98 
 
 		 798 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  42.44 
 
 		 212 aa  178  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  31.79 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  29.18 
 
 		 532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  27.52 
 
 		 537 aa  170  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  31.07 
 
 		 435 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  31.47 
 
 		 408 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  30.77 
 
 		 464 aa  162  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  31.08 
 
 		 538 aa  161  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  27.99 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  28.08 
 
 		 663 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  29.07 
 
 		 415 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  31.07 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  27.89 
 
 		 473 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  27.68 
 
 		 486 aa  144  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  28.41 
 
 		 441 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  28.03 
 
 		 479 aa  143  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  30.61 
 
 		 711 aa  143  6e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  29.12 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  29.5 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  28.07 
 
 		 479 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  28.57 
 
 		 485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  29.02 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  28.92 
 
 		 429 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  28.32 
 
 		 483 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  29.69 
 
 		 644 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  28.92 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  27.34 
 
 		 431 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  28.5 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  26.85 
 
 		 479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  26.73 
 
 		 627 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  29.02 
 
 		 596 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  26.54 
 
 		 581 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1302  glycoside hydrolase family alpha-L-fucosidase  25.23 
 
 		 540 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.186001 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  28.84 
 
 		 474 aa  113  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  24.23 
 
 		 555 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  24.42 
 
 		 471 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  27.22 
 
 		 674 aa  107  7e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  24.74 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  27.73 
 
 		 478 aa  100  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  25.61 
 
 		 447 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  25.89 
 
 		 450 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  26.58 
 
 		 340 aa  88.6  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  37.61 
 
 		 704 aa  61.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  41.89 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  32.04 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 		 638 aa  57.4  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.63 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  37.84 
 
 		 690 aa  56.2  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.19 
 
 		 688 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  34.13 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.04 
 
 		 698 aa  53.9  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  37.84 
 
 		 463 aa  53.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  36.49 
 
 		 606 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.49 
 
 		 687 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.54 
 
 		 487 aa  50.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  43.1 
 
 		 581 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  25.99 
 
 		 460 aa  48.5  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  26.04 
 
 		 460 aa  47.8  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.27 
 
 		 704 aa  45.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  23.49 
 
 		 750 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  23.49 
 
 		 932 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>