66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2072 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 
486 aa  1013    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  50.11 
 
 
516 aa  471  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  45.26 
 
 
555 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1302  glycoside hydrolase family alpha-L-fucosidase  39.11 
 
 
540 aa  348  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.186001 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  39.51 
 
 
464 aa  324  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  38.14 
 
 
484 aa  318  1e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  39.32 
 
 
466 aa  316  5e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  36.79 
 
 
532 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  35.47 
 
 
606 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  35.27 
 
 
584 aa  291  3e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  34.92 
 
 
537 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  34.51 
 
 
505 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  34.38 
 
 
515 aa  280  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  36.2 
 
 
534 aa  277  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  34.1 
 
 
495 aa  252  1e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  32.61 
 
 
798 aa  205  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  31.66 
 
 
663 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  31.85 
 
 
483 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  28.43 
 
 
446 aa  167  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  28.06 
 
 
446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  28.48 
 
 
731 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  29.32 
 
 
463 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  27.6 
 
 
490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  27.68 
 
 
478 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  26.9 
 
 
471 aa  143  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  25.16 
 
 
473 aa  131  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  25.16 
 
 
492 aa  130  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  25.56 
 
 
500 aa  126  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  24.85 
 
 
482 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  29.54 
 
 
627 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  23.9 
 
 
435 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  25.98 
 
 
494 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  26.79 
 
 
473 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  26.22 
 
 
441 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  25.93 
 
 
435 aa  100  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  22.7 
 
 
479 aa  93.6  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  23.95 
 
 
474 aa  93.2  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  25.23 
 
 
596 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  24 
 
 
485 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  22.81 
 
 
471 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  27.3 
 
 
473 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  24.12 
 
 
464 aa  91.3  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  21.79 
 
 
479 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  26.74 
 
 
711 aa  89.7  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  25.05 
 
 
479 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  24.59 
 
 
452 aa  86.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  25.45 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  25.14 
 
 
447 aa  84  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  21.97 
 
 
429 aa  83.6  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  22.83 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  25 
 
 
538 aa  82.8  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  24.44 
 
 
450 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  23.33 
 
 
644 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  24.93 
 
 
445 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  22.99 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  24.86 
 
 
431 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  23.06 
 
 
408 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  22.16 
 
 
581 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  26.52 
 
 
470 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  22.44 
 
 
674 aa  61.6  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  25.17 
 
 
410 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  28.36 
 
 
478 aa  57  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  24.91 
 
 
212 aa  55.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  22.22 
 
 
415 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  27.74 
 
 
463 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  22.14 
 
 
340 aa  43.5  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>