66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1541 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 516 aa  1063    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  50.11 
 
 		 486 aa  472  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1302  glycoside hydrolase family alpha-L-fucosidase  41.73 
 
 		 540 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.186001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  39.64 
 
 		 555 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  39.26 
 
 		 484 aa  311  2e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  39.13 
 
 		 464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  39.09 
 
 		 466 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  38.81 
 
 		 515 aa  293  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  37.18 
 
 		 532 aa  293  5e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  37.84 
 
 		 606 aa  293  7e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  37.57 
 
 		 584 aa  292  8e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  35.04 
 
 		 537 aa  280  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  36.8 
 
 		 495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  32.89 
 
 		 505 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  31.64 
 
 		 534 aa  247  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  32.68 
 
 		 798 aa  207  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  31.48 
 
 		 663 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  32.02 
 
 		 483 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  28.81 
 
 		 731 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  27.99 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  28.81 
 
 		 490 aa  154  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  27.06 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  27.71 
 
 		 463 aa  146  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  27.9 
 
 		 446 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  26.9 
 
 		 482 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  27.73 
 
 		 446 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  25.66 
 
 		 473 aa  127  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  25.3 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  26.49 
 
 		 500 aa  114  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  27.65 
 
 		 627 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  24.53 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  27.06 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  25.05 
 
 		 464 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  26.07 
 
 		 479 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  25.14 
 
 		 435 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  27.68 
 
 		 408 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  27.88 
 
 		 473 aa  97.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  26.6 
 
 		 446 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  23.34 
 
 		 441 aa  94.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  24.28 
 
 		 473 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  24.79 
 
 		 452 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  23.25 
 
 		 479 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  23.68 
 
 		 471 aa  87.4  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  24.64 
 
 		 485 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  26.02 
 
 		 538 aa  85.1  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  25.47 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  22.69 
 
 		 596 aa  83.6  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  23.74 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  24.63 
 
 		 429 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  23.15 
 
 		 711 aa  81.3  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  24.12 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  24.8 
 
 		 581 aa  80.1  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  23.9 
 
 		 674 aa  79.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  23.01 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  24.18 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  23.84 
 
 		 644 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  23.43 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  23.68 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  23.12 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  25.98 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  28.46 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  20.97 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  23.96 
 
 		 638 aa  51.2  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.47 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  24.41 
 
 		 474 aa  43.9  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.91 
 
 		 687 aa  43.5  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>