More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2322 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2322  YD repeat-containing protein  100 
 
 
730 aa  1471    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.505225  decreased coverage  0.0077157 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2324  YD repeat-containing protein  80.81 
 
 
765 aa  764    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.2713  decreased coverage  0.00718158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  92.93 
 
 
6109 aa  765    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3360  hypothetical protein  44.83 
 
 
342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  28.3 
 
 
1485 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  27.66 
 
 
2225 aa  97.4  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  28.15 
 
 
1576 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  29.08 
 
 
678 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  26.8 
 
 
2178 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25 
 
 
2096 aa  91.3  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.6 
 
 
1271 aa  89.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  26 
 
 
2221 aa  89  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  26.13 
 
 
765 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  26.2 
 
 
2224 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  27.38 
 
 
765 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25.83 
 
 
2246 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  25.51 
 
 
2224 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  25.51 
 
 
2224 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  28.23 
 
 
1467 aa  85.1  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  25.86 
 
 
1976 aa  84.7  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  27.16 
 
 
1572 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  25.26 
 
 
2486 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  26.86 
 
 
2349 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 
1959 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  30.3 
 
 
561 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  26.56 
 
 
2658 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  31.65 
 
 
903 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  25.3 
 
 
1917 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  27.55 
 
 
924 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  27.23 
 
 
1464 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  35.24 
 
 
2374 aa  79  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  28.33 
 
 
451 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  28.76 
 
 
1348 aa  79  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  28.69 
 
 
1614 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.79 
 
 
1568 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  27.92 
 
 
504 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  26.3 
 
 
2942 aa  77.4  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  23.85 
 
 
3193 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.99 
 
 
1600 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.35 
 
 
1352 aa  77.4  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.16 
 
 
1840 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.65 
 
 
1942 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  26.37 
 
 
1531 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  28.28 
 
 
1362 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  25.97 
 
 
1732 aa  73.9  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  28.36 
 
 
598 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  26.91 
 
 
1489 aa  71.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  23.5 
 
 
1669 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  28.57 
 
 
1411 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  29.03 
 
 
741 aa  71.2  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  27.37 
 
 
867 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  30.54 
 
 
788 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  29.17 
 
 
866 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  30.54 
 
 
788 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  30.11 
 
 
1508 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  24.15 
 
 
1427 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  28.94 
 
 
1485 aa  70.1  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.43 
 
 
3027 aa  70.1  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  26.29 
 
 
480 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  29.39 
 
 
705 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  27.78 
 
 
2149 aa  68.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  29 
 
 
764 aa  68.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.74 
 
 
1586 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  27.2 
 
 
1611 aa  68.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  27.1 
 
 
1008 aa  68.2  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  27.1 
 
 
1008 aa  68.2  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  24.9 
 
 
3689 aa  68.2  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  25.4 
 
 
1409 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  30.96 
 
 
1488 aa  67.4  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.81 
 
 
1595 aa  67  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  28.52 
 
 
396 aa  67  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  28.45 
 
 
1400 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  29.8 
 
 
1550 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  31.64 
 
 
482 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  35.78 
 
 
1626 aa  66.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  32.55 
 
 
889 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  25.31 
 
 
1639 aa  65.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  26.2 
 
 
1554 aa  65.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0355  YD repeat-containing protein  28.9 
 
 
414 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  29.51 
 
 
1527 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  27.21 
 
 
1599 aa  65.1  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2646  RHS protein  26.25 
 
 
583 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  29.22 
 
 
1520 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  31.02 
 
 
1379 aa  64.3  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  28.14 
 
 
1386 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  27.69 
 
 
1620 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  26.99 
 
 
1345 aa  63.9  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  26.99 
 
 
1345 aa  63.9  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  27.3 
 
 
1551 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  31.07 
 
 
474 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  26.63 
 
 
2145 aa  63.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1132  wall-associated protein  29.3 
 
 
382 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0407345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  23.74 
 
 
2294 aa  62.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  25.66 
 
 
738 aa  63.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  27.99 
 
 
1422 aa  62  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  22.93 
 
 
869 aa  62.4  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  29.3 
 
 
400 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.71 
 
 
1381 aa  62.4  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3794  Rhs family protein  31.45 
 
 
357 aa  62.4  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.279283  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  24.51 
 
 
1991 aa  61.6  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0172483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>