84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0606 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 3662 aa  7541    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  38.1 
 
 		 2864 aa  366  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1524  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1619 aa  315  9e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.0000611783  normal  0.152369 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3207  RHS repeat-containing protein  33.42 
 
 		 2513 aa  293  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  34.78 
 
 		 3794 aa  265  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4783  hypothetical protein  44.72 
 
 		 336 aa  102  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000597107  normal  0.813715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0609  hypothetical protein  49.46 
 
 		 333 aa  100  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.313913  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2435  Thrombospondin type 3 repeat protein  42.98 
 
 		 522 aa  91.3  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.492834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1730  cysteine-rich repeat protein  38.52 
 
 		 780 aa  85.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  38.71 
 
 		 852 aa  85.1  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  36.15 
 
 		 1753 aa  83.2  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6059  Thrombospondin type 3 repeat protein  37.72 
 
 		 292 aa  82.8  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  35.11 
 
 		 1073 aa  76.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1172 aa  74.7  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3626  hypothetical protein  43.96 
 
 		 576 aa  72.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00173227  normal  0.0443221 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  38.62 
 
 		 420 aa  71.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  37.6 
 
 		 1157 aa  68.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.04 
 
 		 3027 aa  65.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3008  hypothetical protein  39.78 
 
 		 913 aa  65.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.36 
 
 		 2096 aa  64.3  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 		 440 aa  63.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1395  YD repeat protein  37.5 
 
 		 1463 aa  62.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7099  YD repeat protein  35.71 
 
 		 1480 aa  62  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00495038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3613  hypothetical protein  43.66 
 
 		 254 aa  62  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.389609  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0513  hypothetical protein  35.87 
 
 		 2843 aa  61.6  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  36.43 
 
 		 322 aa  61.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4225  hypothetical protein  34.69 
 
 		 809 aa  60.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2668  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1743 aa  60.1  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  21.37 
 
 		 1572 aa  59.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  33.33 
 
 		 2510 aa  58.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  22 
 
 		 1576 aa  58.2  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  25.08 
 
 		 2418 aa  58.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  37.4 
 
 		 319 aa  57.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  42.05 
 
 		 428 aa  57  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  52.08 
 
 		 1935 aa  56.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5288  hypothetical protein  43.86 
 
 		 688 aa  55.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6058  hypothetical protein  42.31 
 
 		 353 aa  55.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.33 
 
 		 447 aa  55.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0876  peptidase domain protein  32.43 
 
 		 843 aa  54.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  25.19 
 
 		 927 aa  53.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  23.88 
 
 		 1669 aa  53.5  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  37.37 
 
 		 2443 aa  53.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1987 aa  52.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  24.48 
 
 		 1917 aa  53.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 		 487 aa  52  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  31.45 
 
 		 2486 aa  52  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  28.67 
 
 		 1586 aa  50.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3905  Thrombospondin type 3 repeat protein  35.35 
 
 		 259 aa  50.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  28.67 
 
 		 1595 aa  50.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.58 
 
 		 1840 aa  50.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  34.68 
 
 		 427 aa  50.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  34.19 
 
 		 1264 aa  50.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3470  hypothetical protein  29.93 
 
 		 2836 aa  50.1  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0237631 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  31.15 
 
 		 623 aa  50.1  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4641  YD repeat protein  26.48 
 
 		 1461 aa  49.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32679  hitchhiker  0.00117662 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  24.21 
 
 		 2942 aa  49.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4142  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1409 aa  49.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369154  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  34.48 
 
 		 386 aa  49.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  37.11 
 
 		 490 aa  49.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.06 
 
 		 412 aa  48.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 417 aa  48.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  30.46 
 
 		 6272 aa  48.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.47 
 
 		 1942 aa  49.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  21.81 
 
 		 1565 aa  48.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  34.31 
 
 		 2652 aa  48.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  21.81 
 
 		 1565 aa  48.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  41.46 
 
 		 429 aa  48.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  37.14 
 
 		 2479 aa  48.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  22.1 
 
 		 1611 aa  48.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  34.41 
 
 		 952 aa  48.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1231  insecticidal toxin protein, putative  24.71 
 
 		 922 aa  48.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  29.06 
 
 		 2554 aa  47.8  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  35.42 
 
 		 980 aa  48.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0658  PHB depolymerase family esterase  57.14 
 
 		 683 aa  47.8  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.726264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6648  hypothetical protein  40.79 
 
 		 2113 aa  47.8  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3289  PHB depolymerase family esterase  57.14 
 
 		 683 aa  47.8  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  28.21 
 
 		 671 aa  47.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  35.9 
 
 		 727 aa  47  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  39.29 
 
 		 402 aa  47  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  32.26 
 
 		 458 aa  47  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  32.76 
 
 		 386 aa  47  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  36.9 
 
 		 1854 aa  47  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  27.27 
 
 		 1614 aa  46.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1317 aa  46.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>