38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7099 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4142  hypothetical protein  41.65 
 
 		 1409 aa  951    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369154  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1395  YD repeat protein  65.76 
 
 		 1463 aa  1727    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  37.73 
 
 		 2418 aa  820    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4225  hypothetical protein  70.65 
 
 		 809 aa  1165    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4386  hypothetical protein  39.45 
 
 		 1179 aa  814    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.241332  decreased coverage  0.00292232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4641  YD repeat protein  67.51 
 
 		 1461 aa  1711    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32679  hitchhiker  0.00117662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7099  YD repeat protein  100 
 
 		 1480 aa  3044    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00495038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2076  YD repeat protein  34.61 
 
 		 1740 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3008  hypothetical protein  45.05 
 
 		 913 aa  539  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  32.09 
 
 		 1753 aa  333  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2668  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1743 aa  332  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3007  hypothetical protein  43.79 
 
 		 503 aa  302  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  30.75 
 
 		 1157 aa  293  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1172 aa  287  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  30.72 
 
 		 1073 aa  146  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  30.4 
 
 		 2864 aa  68.6  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  26.79 
 
 		 3794 aa  64.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  35.71 
 
 		 3662 aa  62  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.3 
 
 		 1576 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3207  RHS repeat-containing protein  27.16 
 
 		 2513 aa  58.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  23.33 
 
 		 1572 aa  56.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  23.79 
 
 		 1352 aa  55.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3613  hypothetical protein  48.89 
 
 		 254 aa  51.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.389609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  27.75 
 
 		 690 aa  51.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  22.02 
 
 		 3689 aa  50.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  23.59 
 
 		 1595 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  23.5 
 
 		 1586 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  28.45 
 
 		 927 aa  49.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  23.08 
 
 		 1614 aa  48.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  32.43 
 
 		 952 aa  48.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  29.86 
 
 		 1834 aa  48.5  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2450  RHS protein  25.37 
 
 		 414 aa  48.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.132039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  25.15 
 
 		 1485 aa  47.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.47 
 
 		 1271 aa  47.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  23.75 
 
 		 2277 aa  46.2  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  29.1 
 
 		 3273 aa  46.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  36.27 
 
 		 927 aa  46.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  35 
 
 		 886 aa  45.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>