60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3008 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3008  hypothetical protein  100 
 
 		 913 aa  1885    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4386  hypothetical protein  49.61 
 
 		 1179 aa  624  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.241332  decreased coverage  0.00292232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4142  hypothetical protein  46.96 
 
 		 1409 aa  596  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369154  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1395  YD repeat protein  45.29 
 
 		 1463 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4225  hypothetical protein  45.2 
 
 		 809 aa  555  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  43.24 
 
 		 2418 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4641  YD repeat protein  45.8 
 
 		 1461 aa  544  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32679  hitchhiker  0.00117662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7099  YD repeat protein  45.05 
 
 		 1480 aa  538  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00495038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2076  YD repeat protein  35.6 
 
 		 1740 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  32.11 
 
 		 1753 aa  114  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2668  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1743 aa  114  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  38.85 
 
 		 1157 aa  103  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3613  hypothetical protein  73.47 
 
 		 254 aa  87.4  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.389609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  38.17 
 
 		 1172 aa  82  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  36.63 
 
 		 1073 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  40.4 
 
 		 2864 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  39.78 
 
 		 3662 aa  65.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3207  RHS repeat-containing protein  37.63 
 
 		 2513 aa  61.6  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  28.08 
 
 		 3456 aa  60.1  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  32.82 
 
 		 1464 aa  57.4  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  35.64 
 
 		 2443 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_002978  WD0513  hypothetical protein  42 
 
 		 2843 aa  52  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3696  hypothetical protein  41.18 
 
 		 273 aa  51.6  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  35.35 
 
 		 2510 aa  50.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  30.2 
 
 		 2286 aa  50.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  30 
 
 		 628 aa  50.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  33.62 
 
 		 886 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  28.35 
 
 		 1834 aa  49.7  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  41.67 
 
 		 2554 aa  49.7  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  30 
 
 		 554 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2749  YD repeat protein  35.64 
 
 		 2808 aa  48.9  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  29.92 
 
 		 482 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  25 
 
 		 1976 aa  48.5  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  27.1 
 
 		 2374 aa  48.5  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  23.08 
 
 		 2494 aa  48.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  28.76 
 
 		 980 aa  48.1  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  38.89 
 
 		 1623 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  29.45 
 
 		 956 aa  47.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  35 
 
 		 955 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  34.75 
 
 		 921 aa  47.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  34.15 
 
 		 1053 aa  46.6  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  30.69 
 
 		 952 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  43.14 
 
 		 1433 aa  46.2  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4251  YD repeat-containing protein  30.12 
 
 		 1628 aa  46.2  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.196463  normal  0.674162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  28.57 
 
 		 928 aa  45.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4783  hypothetical protein  27.88 
 
 		 336 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000597107  normal  0.813715 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  25.45 
 
 		 3320 aa  45.4  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  33.33 
 
 		 316 aa  45.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  29.63 
 
 		 298 aa  45.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  29.63 
 
 		 298 aa  45.4  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  37.68 
 
 		 2558 aa  45.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  27.83 
 
 		 2413 aa  45.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  30 
 
 		 942 aa  45.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1566  hypothetical protein  31 
 
 		 360 aa  45.4  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0920602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  29.13 
 
 		 474 aa  45.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  32.35 
 
 		 2417 aa  45.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  40.43 
 
 		 2007 aa  45.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  34.62 
 
 		 722 aa  45.1  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  33.01 
 
 		 940 aa  44.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  32.35 
 
 		 2698 aa  45.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>