21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4386 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7099  YD repeat protein  39.45 
 
 		 1480 aa  814    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00495038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4641  YD repeat protein  40.76 
 
 		 1461 aa  856    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32679  hitchhiker  0.00117662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4386  hypothetical protein  100 
 
 		 1179 aa  2439    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.241332  decreased coverage  0.00292232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1395  YD repeat protein  39.14 
 
 		 1463 aa  787    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  35.81 
 
 		 2418 aa  683    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4142  hypothetical protein  44.82 
 
 		 1409 aa  990    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369154  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3008  hypothetical protein  49.61 
 
 		 913 aa  624  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4225  hypothetical protein  41.84 
 
 		 809 aa  568  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2076  YD repeat protein  29.98 
 
 		 1740 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3007  hypothetical protein  37.65 
 
 		 503 aa  327  8.000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  27.21 
 
 		 1157 aa  207  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1172 aa  207  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.25 
 
 		 1753 aa  192  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2668  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1743 aa  191  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  25.41 
 
 		 1073 aa  110  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  27.19 
 
 		 3794 aa  63.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  27.34 
 
 		 2864 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3207  RHS repeat-containing protein  29.55 
 
 		 2513 aa  49.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  25.07 
 
 		 1268 aa  47.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  30.14 
 
 		 1417 aa  45.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  30.14 
 
 		 1410 aa  45.1  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>