24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4641 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7099  YD repeat protein  67.51 
 
 		 1480 aa  1711    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00495038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4641  YD repeat protein  100 
 
 		 1461 aa  3013    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32679  hitchhiker  0.00117662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4386  hypothetical protein  40.76 
 
 		 1179 aa  856    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.241332  decreased coverage  0.00292232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4225  hypothetical protein  72.17 
 
 		 809 aa  1169    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4142  hypothetical protein  40.29 
 
 		 1409 aa  734    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369154  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  39.3 
 
 		 2418 aa  784    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1395  YD repeat protein  66 
 
 		 1463 aa  1718    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2076  YD repeat protein  36.8 
 
 		 1740 aa  647    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3008  hypothetical protein  45.8 
 
 		 913 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  32.76 
 
 		 1172 aa  333  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  31.64 
 
 		 1753 aa  330  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  32.84 
 
 		 1157 aa  328  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2668  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1743 aa  327  7e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3007  hypothetical protein  36.7 
 
 		 503 aa  315  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  31.77 
 
 		 1073 aa  159  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  29.61 
 
 		 2864 aa  70.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  27.15 
 
 		 3794 aa  69.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3207  RHS repeat-containing protein  25.96 
 
 		 2513 aa  66.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  28.61 
 
 		 690 aa  58.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  28.57 
 
 		 927 aa  57  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  25.57 
 
 		 3689 aa  51.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  26.04 
 
 		 2117 aa  50.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  26.25 
 
 		 3662 aa  46.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0513  hypothetical protein  24.66 
 
 		 2843 aa  45.1  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>