18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3696 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3696  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  555  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  41.77 
 
 
1073 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3664  hypothetical protein  56.52 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  51.02 
 
 
1157 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3613  hypothetical protein  54.76 
 
 
254 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.389609  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  52.38 
 
 
1753 aa  52.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2668  hypothetical protein  58.7 
 
 
1743 aa  52.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3008  hypothetical protein  41.18 
 
 
913 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  34.25 
 
 
1172 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  47.83 
 
 
2007 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  52.27 
 
 
2615 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  45.1 
 
 
2286 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1395  YD repeat protein  40.43 
 
 
1463 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  47.83 
 
 
1140 aa  45.8  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  40.48 
 
 
3662 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2907  hypothetical protein  37.1 
 
 
340 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  28.16 
 
 
2402 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  37.74 
 
 
1854 aa  42  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>