16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3664 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3664  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  614  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3696  hypothetical protein  56.52 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  42.86 
 
 
1753 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2668  hypothetical protein  45.1 
 
 
1743 aa  49.3  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3613  hypothetical protein  47.62 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.389609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1395  YD repeat protein  29.37 
 
 
1463 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2907  hypothetical protein  32.26 
 
 
340 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  35.63 
 
 
1854 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  44.68 
 
 
1157 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3834  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 
1723 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.806398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  39.22 
 
 
2286 aa  46.6  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1456  YD repeat-containing protein  30.38 
 
 
1689 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.368139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2040  YD repeat-containing protein  46.51 
 
 
1682 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.76692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2167  YD repeat-containing protein  38.18 
 
 
622 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  37.25 
 
 
1140 aa  42.7  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  42 
 
 
1172 aa  42.4  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>