58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3613 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3613  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  525  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.389609  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  85.42 
 
 		 1753 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3008  hypothetical protein  73.47 
 
 		 913 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  76 
 
 		 1157 aa  85.5  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1395  YD repeat protein  70.59 
 
 		 1463 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  60.78 
 
 		 1172 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4225  hypothetical protein  59.57 
 
 		 809 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  44.64 
 
 		 2418 aa  65.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  60.87 
 
 		 1073 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  43.66 
 
 		 3662 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2076  YD repeat protein  49.09 
 
 		 1740 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  37.5 
 
 		 2864 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3696  hypothetical protein  54.76 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0513  hypothetical protein  48.28 
 
 		 2843 aa  54.3  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3207  RHS repeat-containing protein  47.92 
 
 		 2513 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  44.64 
 
 		 2417 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7099  YD repeat protein  48.89 
 
 		 1480 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00495038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  48.21 
 
 		 2443 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  35.48 
 
 		 1976 aa  48.9  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3660  YD repeat-containing protein  45.65 
 
 		 2007 aa  48.5  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3664  hypothetical protein  47.62 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  38.98 
 
 		 3456 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4142  hypothetical protein  46.15 
 
 		 1409 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369154  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  34.43 
 
 		 928 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  44.68 
 
 		 1053 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  44.9 
 
 		 1464 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2678  hypothetical protein  64.71 
 
 		 230 aa  46.2  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.733983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3706  hypothetical protein  58.82 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.534403  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  42.22 
 
 		 2286 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  43.75 
 
 		 2615 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  41.38 
 
 		 2554 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00908  putative RSH-related protein  36.73 
 
 		 319 aa  45.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.303359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2668  hypothetical protein  46.81 
 
 		 1743 aa  45.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4783  hypothetical protein  46.67 
 
 		 336 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000597107  normal  0.813715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  41.07 
 
 		 628 aa  45.4  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3610  hypothetical protein  64.71 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.141644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  42 
 
 		 2458 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0177  hypothetical protein  44.23 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  42.55 
 
 		 1140 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  44.44 
 
 		 2076 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  44.68 
 
 		 886 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3884  YD repeat protein  39.29 
 
 		 1879 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  31.33 
 
 		 2401 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  41.86 
 
 		 741 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1566  hypothetical protein  39.71 
 
 		 360 aa  42.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0920602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4641  YD repeat protein  45.65 
 
 		 1461 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.32679  hitchhiker  0.00117662 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  47.62 
 
 		 788 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  47.62 
 
 		 788 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  35.71 
 
 		 927 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  37.93 
 
 		 2558 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  38.46 
 
 		 1147 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  39.58 
 
 		 1935 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1350  YD repeat-containing protein  40.43 
 
 		 2046 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  43.75 
 
 		 1352 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  42.22 
 
 		 2350 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  43.75 
 
 		 1710 aa  42  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  41.67 
 
 		 2510 aa  42  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  32.73 
 
 		 2035 aa  42  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>