17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4783 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4783  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  693    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000597107  normal  0.813715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  79.73 
 
 		 2864 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  44.72 
 
 		 3662 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3207  RHS repeat-containing protein  56 
 
 		 2513 aa  90.1  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0609  hypothetical protein  53.42 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.313913  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1098  hypothetical protein  43.06 
 
 		 1172 aa  53.1  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00467719  unclonable  0.0000000000319304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3729  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  41.43 
 
 		 1753 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1050  YD repeat-containing protein  42.03 
 
 		 1157 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2123  YD repeat protein  41.07 
 
 		 1073 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8840  hypothetical protein  28.33 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2678  hypothetical protein  46 
 
 		 230 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.733983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3706  hypothetical protein  40.3 
 
 		 270 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.534403  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1395  YD repeat protein  43.84 
 
 		 1463 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3610  hypothetical protein  44 
 
 		 230 aa  46.6  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.141644  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3613  hypothetical protein  46.67 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.389609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3008  hypothetical protein  27.88 
 
 		 913 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  39.19 
 
 		 3456 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>