30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3626 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3626  hypothetical protein  100 
 
 		 576 aa  1191    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00173227  normal  0.0443221 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  50 
 
 		 852 aa  90.9  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0818  hypothetical protein  34.55 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.4746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0272  hypothetical protein  36.96 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0855  hypothetical protein  39.82 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0841  hypothetical protein  33.94 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140514  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  41.03 
 
 		 3662 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6059  Thrombospondin type 3 repeat protein  50 
 
 		 292 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3470  hypothetical protein  44.26 
 
 		 2836 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0237631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 417 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  57.89 
 
 		 1935 aa  52.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2066  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1023 aa  50.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1325  hypothetical protein  48 
 
 		 483 aa  50.8  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000125315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  33.71 
 
 		 401 aa  50.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  44.62 
 
 		 402 aa  48.5  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  31.39 
 
 		 427 aa  48.9  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  34.58 
 
 		 381 aa  48.9  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1840  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1084 aa  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6058  hypothetical protein  43.75 
 
 		 353 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1843  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1135 aa  48.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  34.31 
 
 		 428 aa  47.4  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  39.19 
 
 		 368 aa  47  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  35.58 
 
 		 322 aa  47  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  41.77 
 
 		 1707 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2435  Thrombospondin type 3 repeat protein  39.77 
 
 		 522 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.492834 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  45.45 
 
 		 294 aa  46.2  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  36.84 
 
 		 366 aa  45.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.92 
 
 		 447 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 543 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2056  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1027 aa  43.9  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>