23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2435 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2435  Thrombospondin type 3 repeat protein  100 
 
 		 522 aa  985    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.492834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6059  Thrombospondin type 3 repeat protein  48.43 
 
 		 292 aa  150  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  37.3 
 
 		 3662 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  47.52 
 
 		 852 aa  81.3  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1730  cysteine-rich repeat protein  42.08 
 
 		 780 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00819  hypothetical protein  38 
 
 		 823 aa  60.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  30.5 
 
 		 1831 aa  50.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  30.77 
 
 		 14609 aa  50.4  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  61.54 
 
 		 1935 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  35.47 
 
 		 440 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3289  PHB depolymerase family esterase  58.97 
 
 		 683 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0658  PHB depolymerase family esterase  58.97 
 
 		 683 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.726264 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  27.59 
 
 		 722 aa  47.4  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000258397 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3626  hypothetical protein  39.77 
 
 		 576 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00173227  normal  0.0443221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  33.33 
 
 		 4357 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6058  hypothetical protein  47.14 
 
 		 353 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  36.96 
 
 		 3861 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1987 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  40 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3470  hypothetical protein  55 
 
 		 2836 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0237631 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  35.71 
 
 		 420 aa  45.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  36.17 
 
 		 487 aa  44.3  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1507  lysyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 537 aa  43.5  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>