45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5288 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5288  hypothetical protein  100 
 
 		 688 aa  1335    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1730  cysteine-rich repeat protein  46.81 
 
 		 780 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  36.62 
 
 		 1987 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  33.53 
 
 		 722 aa  70.9  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00819  hypothetical protein  36.1 
 
 		 823 aa  70.9  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  42.36 
 
 		 852 aa  69.3  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  37.69 
 
 		 440 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  41.1 
 
 		 1264 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6059  Thrombospondin type 3 repeat protein  38.6 
 
 		 292 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  31.37 
 
 		 722 aa  64.7  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000258397 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  32.45 
 
 		 792 aa  63.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.16 
 
 		 447 aa  62.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  29.45 
 
 		 2074 aa  56.6  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  36.47 
 
 		 3662 aa  55.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  28.1 
 
 		 14609 aa  54.3  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36.62 
 
 		 319 aa  53.9  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  35.33 
 
 		 420 aa  53.5  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  39.61 
 
 		 374 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  33.61 
 
 		 671 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2046  tryptophan synthase, beta chain  32.91 
 
 		 1369 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 487 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  32.49 
 
 		 1755 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  31.41 
 
 		 417 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 543 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 428 aa  51.6  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  35.95 
 
 		 478 aa  52  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 		 456 aa  50.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  40.62 
 
 		 294 aa  50.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  40.37 
 
 		 6109 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 623 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  39 
 
 		 542 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2435  Thrombospondin type 3 repeat protein  31.47 
 
 		 522 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.492834 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  41.74 
 
 		 322 aa  49.3  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  39.5 
 
 		 458 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  34.44 
 
 		 320 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  29.49 
 
 		 1707 aa  48.5  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  32.86 
 
 		 637 aa  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  39 
 
 		 544 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 727 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  38.36 
 
 		 386 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  34.38 
 
 		 427 aa  45.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  37.78 
 
 		 490 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  33.16 
 
 		 1908 aa  43.9  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0876  peptidase domain protein  33.33 
 
 		 843 aa  43.9  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 386 aa  43.9  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>