20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1717 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1717  Disintegrin  100 
 
 
313 aa  610  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0506026 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00310  conserved hypothetical protein  33.56 
 
 
912 aa  64.3  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02810  ADAM family of metalloprotease ADM-A (AFU_orthologue; AFUA_6G14420)  44.72 
 
 
722 aa  62.4  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.096778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0754  EGF calcium-binding domain protein  44.62 
 
 
460 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5943  Disintegrin  36.67 
 
 
343 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05619  ADAM family of metalloprotease ADM-B (AFU_orthologue; AFUA_4G11150)  31.65 
 
 
825 aa  58.5  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00103668  normal  0.0270477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1383  EGF calcium-binding domain protein  43.55 
 
 
387 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1609  cysteine-rich repeat protein  31.98 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.131979  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1391  EGF calcium-binding domain protein  38.75 
 
 
428 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510113  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03040  zinc metalloprotease precursor, putative  32.67 
 
 
614 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.195421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  36.2 
 
 
602 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2880  hypothetical protein  31.58 
 
 
992 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4804  cysteine-rich repeat protein  51.11 
 
 
309 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0204235  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0988  hypothetical protein  45.65 
 
 
990 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318965  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1332  cysteine-rich repeat protein  55 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3363  disintegrin  37.38 
 
 
448 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_8924  predicted protein  47.37 
 
 
106 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.132929  normal  0.100166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4805  cysteine-rich repeat protein  42.86 
 
 
851 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115488  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0626  Disintegrin  47.37 
 
 
412 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1094  cysteine-rich repeat protein  54.55 
 
 
663 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.946471  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>