27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0068 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0068  cysteine-rich repeat protein  100 
 
 
1001 aa  2038    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  39.36 
 
 
715 aa  58.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2527  cysteine-rich repeat protein  49.33 
 
 
2055 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8540  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  24.11 
 
 
889 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810503  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4805  cysteine-rich repeat protein  51.56 
 
 
851 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115488  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2937  protease-associated PA  32.14 
 
 
730 aa  48.9  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0985  hypothetical protein  52.08 
 
 
348 aa  48.9  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  40.54 
 
 
1793 aa  48.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2242  neutral metalloprotease, putative  26.89 
 
 
503 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.848329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2324  putative neutral metalloprotease  26.89 
 
 
503 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000332319  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0984  cysteine-rich repeat protein  37.93 
 
 
701 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.413699  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3130  putative neutral metalloprotease  26.73 
 
 
503 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0709705  normal  0.0367114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  45.9 
 
 
794 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3130  peptidase M36 fungalysin  32.65 
 
 
730 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2169  cysteine-rich repeat protein  46.38 
 
 
378 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0145186  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2189  putative neutral metalloprotease  26.73 
 
 
503 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1996  bacillolysin  26.42 
 
 
503 aa  45.8  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2826  cysteine-rich repeat protein  41.46 
 
 
645 aa  45.8  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3023  protease-associated PA domain protein  32.65 
 
 
730 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0449431  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2202  putative neutral metalloprotease  26.42 
 
 
503 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000414955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5011  hypothetical protein  24.18 
 
 
814 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0852589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0573  cysteine-rich repeat protein  49.21 
 
 
648 aa  45.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936742  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1978  bacillolysin  26.42 
 
 
503 aa  45.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4804  cysteine-rich repeat protein  48.48 
 
 
309 aa  44.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0204235  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2017  peptidase  25.81 
 
 
503 aa  44.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0329262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2028  neutral metalloprotease  25.94 
 
 
503 aa  44.7  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2183  neutral metalloprotease  25.94 
 
 
503 aa  44.7  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>