12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5888 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5888  cysteine-rich repeat protein  100 
 
 		 709 aa  1394    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  30.78 
 
 		 731 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1061 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.21 
 
 		 465 aa  52  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  25 
 
 		 483 aa  49.7  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  30.07 
 
 		 465 aa  48.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  25.93 
 
 		 1296 aa  47.4  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0573  cysteine-rich repeat protein  39.53 
 
 		 648 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936742  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  34.44 
 
 		 715 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  29.85 
 
 		 1750 aa  45.8  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  56.76 
 
 		 794 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  38.27 
 
 		 460 aa  44.3  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>