42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3328 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3328  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 272 aa  530  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000184033 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2874  polymorphic outer membrane protein  43.26 
 
 		 412 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  36.89 
 
 		 717 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.96 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  32.41 
 
 		 464 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.96 
 
 		 479 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  30.59 
 
 		 509 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  37.39 
 
 		 452 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  32.41 
 
 		 468 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  29.96 
 
 		 593 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  35.29 
 
 		 461 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  38.89 
 
 		 558 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  36.45 
 
 		 459 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.66 
 
 		 462 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  37.23 
 
 		 362 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  33.33 
 
 		 575 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  38.02 
 
 		 591 aa  49.7  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  33.85 
 
 		 454 aa  49.3  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  43.88 
 
 		 591 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  35.45 
 
 		 501 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  33.94 
 
 		 505 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  31.3 
 
 		 530 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  29.29 
 
 		 446 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  37.39 
 
 		 489 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  39.24 
 
 		 454 aa  45.8  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  29.63 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1061 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  30.21 
 
 		 465 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  31.86 
 
 		 483 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  31.21 
 
 		 481 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  31.58 
 
 		 759 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  25.53 
 
 		 541 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  24.03 
 
 		 518 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  23.49 
 
 		 417 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  28.85 
 
 		 459 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  31.11 
 
 		 457 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  29.05 
 
 		 545 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  31.48 
 
 		 466 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  25.95 
 
 		 2042 aa  42.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  32.84 
 
 		 462 aa  42.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  31.33 
 
 		 527 aa  42  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  37.29 
 
 		 493 aa  42  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>