32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2263 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2263  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 408 aa  847    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.374897  normal  0.190888 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  31.97 
 
 		 477 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  28.82 
 
 		 460 aa  142  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  27.87 
 
 		 465 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  28.26 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  28.66 
 
 		 1152 aa  109  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  27.46 
 
 		 453 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  27.46 
 
 		 453 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  27.46 
 
 		 453 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  27.46 
 
 		 453 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  26.79 
 
 		 453 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  26.11 
 
 		 453 aa  100  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  22.28 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  27.52 
 
 		 1223 aa  75.5  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  26.85 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  28.08 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 		 1140 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  25.26 
 
 		 1140 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 1140 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 		 912 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  26.48 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  31.35 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  26.52 
 
 		 571 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 		 1129 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  21.27 
 
 		 432 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0231  glycoside hydrolase family 8  25.71 
 
 		 429 aa  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 511 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0082  endoglucanase Y  25.11 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532728  normal  0.916342 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  25 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  21.9 
 
 		 430 aa  46.6  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4314  glycoside hydrolase family protein  23.81 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  23.35 
 
 		 609 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>